234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2704 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_2704  fructose-1,6-bisphosphatase  100 
 
 
334 aa  691    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1586  fructose-1,6-bisphosphatase  84.94 
 
 
335 aa  599  1e-170  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3263  fructose-1,6-bisphosphatase  81.79 
 
 
335 aa  593  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0139597  hitchhiker  0.00000000837949 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3795  fructose-1,6-bisphosphatase  83.43 
 
 
337 aa  591  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1843  fructose-1,6-bisphosphatase  82.83 
 
 
335 aa  588  1e-167  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0532341  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1067  fructose-1,6-bisphosphatase  84.34 
 
 
335 aa  590  1e-167  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.641395  normal  0.908963 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2250  fructose-1,6-bisphosphatase  80.95 
 
 
339 aa  580  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.523394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2760  fructose-1,6-bisphosphatase  80.65 
 
 
339 aa  578  1e-164  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2775  fructose-1,6-bisphosphatase  81.79 
 
 
336 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1763  fructose-1,6-bisphosphatase  79.94 
 
 
341 aa  572  1.0000000000000001e-162  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106936 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1149  fructose-1,6-bisphosphatase  80.78 
 
 
335 aa  566  1e-160  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.191646  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0875  fructose-1,6-bisphosphatase  76.74 
 
 
338 aa  540  9.999999999999999e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0821253  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2444  fructose-1,6-bisphosphatase  76.51 
 
 
339 aa  534  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1943  fructose-1,6-bisphosphatase  75.68 
 
 
338 aa  537  1e-151  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.713905  normal  0.0350228 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2266  fructose-1,6-bisphosphatase  75.38 
 
 
338 aa  536  1e-151  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.014374  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2126  fructose-1,6-bisphosphatase  75.38 
 
 
338 aa  532  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3071  fructose-1,6-bisphosphatase  69.46 
 
 
338 aa  501  1e-141  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137108  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0469  fructose-1,6-bisphosphatase  68.56 
 
 
338 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3031  fructose-1,6-bisphosphatase  68.56 
 
 
338 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2381  fructose-1,6-bisphosphatase  68.37 
 
 
337 aa  498  1e-140  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.881144 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1604  fructose-1,6-bisphosphatase  68.56 
 
 
338 aa  499  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0685  fructose-1,6-bisphosphatase  69.37 
 
 
338 aa  499  1e-140  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2618  fructose-1,6-bisphosphatase  68.56 
 
 
338 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.36  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0990  fructose-1,6-bisphosphatase  68.56 
 
 
338 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2925  fructose-1,6-bisphosphatase  68.56 
 
 
338 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2987  fructose-1,6-bisphosphatase  68.56 
 
 
338 aa  498  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0157  fructose-1,6-bisphosphatase  68.56 
 
 
338 aa  498  1e-140  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0889  fructose-1,6-bisphosphatase  67.67 
 
 
339 aa  494  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.138169  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0920  fructose-1,6-bisphosphatase  68.86 
 
 
338 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.701252  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0535  fructose-1,6-bisphosphatase  67.77 
 
 
337 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115593  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1014  fructose-1,6-bisphosphatase  67.77 
 
 
337 aa  495  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32393  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0973  fructose-1,6-bisphosphatase  68.07 
 
 
337 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798772  normal  0.126092 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4125  fructose-1,6-bisphosphatase  67.98 
 
 
337 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00362057  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45640  fructose-1,6-bisphosphatase  69.64 
 
 
337 aa  493  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191472  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0877  fructose-1,6-bisphosphatase  67.67 
 
 
339 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0798323  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5168  fructose-1,6-bisphosphatase  67.26 
 
 
336 aa  484  1e-136  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5843  fructose-1,6-bisphosphatase  68.45 
 
 
336 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3283  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  65.88 
 
 
343 aa  484  1e-136  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67490  fructose-1,6-bisphosphatase  68.45 
 
 
336 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309201  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0508  fructose-1,6-bisphosphatase  68.77 
 
 
335 aa  487  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5040  fructose-1,6-bisphosphatase  67.26 
 
 
336 aa  482  1e-135  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0423  fructose-1,6-bisphosphatase  66.96 
 
 
336 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0370  fructose-1,6-bisphosphatase  67.37 
 
 
336 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4914  fructose-1,6-bisphosphatase  66.96 
 
 
336 aa  481  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0352  fructose-1,6-bisphosphatase  66.07 
 
 
336 aa  477  1e-134  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5090  fructose-1,6-bisphosphatase  66.67 
 
 
336 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03469  fructose-1,6-bisphosphatase  66.97 
 
 
336 aa  478  1e-134  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0020  fructose-1,6-bisphosphatase  66.36 
 
 
338 aa  466  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000687853 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1409  fructose-1,6-bisphosphatase  68.37 
 
 
333 aa  464  1e-129  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3589  D-fructose 1,6-bisphosphatase  67.86 
 
 
338 aa  462  1e-129  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0270544 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2577  fructose-1,6-bisphosphatase  60.18 
 
 
337 aa  441  9.999999999999999e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.157967 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0021  fructose-1,6-bisphosphatase  60 
 
 
335 aa  435  1e-121  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193201  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0281  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  60.71 
 
 
336 aa  429  1e-119  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320713  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1859  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  62.69 
 
 
334 aa  425  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000101477  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2319  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  61.24 
 
 
338 aa  424  1e-117  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.514677  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0084  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  60.12 
 
 
337 aa  419  1e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1982  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  57.73 
 
 
364 aa  418  1e-116  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1511  D-fructose 1,6-bisphosphatase  59.3 
 
 
365 aa  417  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422669  decreased coverage  0.0000800022 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3628  fructose-1,6-bisphosphatase  59.09 
 
 
357 aa  414  1e-114  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3755  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  57.56 
 
 
365 aa  410  1e-113  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0189  fructose-1,6-bisphosphatase  58.43 
 
 
339 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0209227  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0368  fructose-1,6-bisphosphatase  58.43 
 
 
339 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.244889  normal  0.233864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1393  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  56.85 
 
 
364 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.834199  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0669  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  59.21 
 
 
335 aa  397  1e-109  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3026  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  53.92 
 
 
358 aa  391  1e-107  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00242569  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1187  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  58.23 
 
 
339 aa  390  1e-107  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.146962 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2636  D-fructose 1,6-bisphosphatase  58.73 
 
 
333 aa  390  1e-107  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0412723  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2450  fructose-1,6-bisphosphatase  54.89 
 
 
378 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709501  normal  0.535256 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2788  D-fructose 1,6-bisphosphatase  53.5 
 
 
357 aa  377  1e-103  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450037  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3013  fructose-1,6-bisphosphatase  59.67 
 
 
322 aa  366  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514687  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0599  fructose-1,6-bisphosphatase  55.62 
 
 
320 aa  359  3e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000176806  normal  0.0298403 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0773  fructose-1,6-bisphosphatase  56.23 
 
 
329 aa  358  5e-98  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  normal  0.0106002 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0586  D-fructose 1,6-bisphosphatase  51.99 
 
 
331 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000325166  normal  0.0963018 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0813  fructose-1,6-bisphosphatase  55.13 
 
 
329 aa  355  5e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000266321  hitchhiker  0.000279081 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0676  fructose-1,6-bisphosphatase  53.87 
 
 
330 aa  354  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000449089  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0784  fructose-1,6-bisphosphatase  53.82 
 
 
342 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0298171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4138  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  55.34 
 
 
319 aa  353  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000256898  unclonable  0.00000000000522982 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1495  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  52.12 
 
 
337 aa  353  2e-96  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000616027  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3721  fructose-1,6-bisphosphatase  54.18 
 
 
330 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.10391  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3991  fructose-1,6-bisphosphatase  55.84 
 
 
325 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0731  fructose-1,6-bisphosphatase  56.09 
 
 
329 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000293174  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3373  fructose-1,6-bisphosphatase  56.17 
 
 
330 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000187487  hitchhiker  0.00208925 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3663  fructose-1,6-bisphosphatase  53.87 
 
 
325 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0199188  hitchhiker  0.00000825139 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3844  fructose-1,6-bisphosphatase  53.82 
 
 
325 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0810382  unclonable  0.00000976669 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0648  fructose-1,6-bisphosphatase  56.17 
 
 
330 aa  352  4e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000605795  hitchhiker  0.00000605277 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0649  fructose-1,6-bisphosphatase  56.17 
 
 
330 aa  352  5e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000012106  normal  0.0500569 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3770  fructose-1,6-bisphosphatase  54.34 
 
 
329 aa  351  8e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000161659  hitchhiker  0.001107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0242  fructose-1,6-bisphosphatase  53.27 
 
 
323 aa  351  1e-95  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0389611  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00214  fructose-1,6-bisphosphatase  53.14 
 
 
325 aa  350  2e-95  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0531  fructose-1,6-bisphosphatase  54.81 
 
 
330 aa  345  6e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.012262  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2986  fructose-1,6-bisphosphatase  53.27 
 
 
330 aa  344  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2403  D-fructose 1,6-bisphosphatase  50.45 
 
 
369 aa  339  4e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96213  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4614  fructose-1,6-bisphosphatase  51.43 
 
 
322 aa  336  3.9999999999999995e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1857  fructose-1,6-bisphosphatase  47.35 
 
 
334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000262461  hitchhiker  0.000253993 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3754  fructose-1,6-bisphosphatase  48.49 
 
 
345 aa  314  9.999999999999999e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.751748  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4046  fructose-1,6-bisphosphatase  52.04 
 
 
345 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.360967  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1481  D-fructose 1,6-bisphosphatase  52.94 
 
 
351 aa  312  3.9999999999999997e-84  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.853817 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0541  fructose-1,6-bisphosphatase  51.13 
 
 
327 aa  312  4.999999999999999e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0530  fructose-1,6-bisphosphatase  49.54 
 
 
327 aa  311  1e-83  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.059521  normal  0.0102388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2694  fructose-1,6-bisphosphatase  50.68 
 
 
345 aa  305  7e-82  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0422248  normal  0.712934 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>