234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_5126 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011004  Rpal_5126  fructose-1,6-bisphosphatase  100 
 
 
343 aa  699    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0947  fructose-1,6-bisphosphatase  84.84 
 
 
343 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1050  fructose-1,6-bisphosphatase  84.64 
 
 
345 aa  561  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2899  fructose-1,6-bisphosphatase  73.84 
 
 
344 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0650295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2694  fructose-1,6-bisphosphatase  62.14 
 
 
345 aa  412  1e-114  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0422248  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4046  fructose-1,6-bisphosphatase  61.7 
 
 
345 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.360967  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3754  fructose-1,6-bisphosphatase  60.69 
 
 
345 aa  409  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.751748  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3920  fructose-1,6-bisphosphatase  48.84 
 
 
349 aa  347  2e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1191  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  50.78 
 
 
352 aa  337  1.9999999999999998e-91  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0640558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1915  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  48.55 
 
 
371 aa  336  2.9999999999999997e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.934073 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6401  D-fructose 1,6-bisphosphatase  50.14 
 
 
347 aa  335  9e-91  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0919  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  50.97 
 
 
348 aa  330  2e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.547714 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0943  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  50.65 
 
 
348 aa  329  4e-89  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.114366  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0979  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  50.65 
 
 
348 aa  328  6e-89  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.194599 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1843  fructose-1,6-bisphosphatase  49.17 
 
 
335 aa  315  9.999999999999999e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0532341  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3528  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  49.54 
 
 
329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3559  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  50.16 
 
 
351 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.163235  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1695  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  50.35 
 
 
330 aa  307  2.0000000000000002e-82  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.23091  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2775  fructose-1,6-bisphosphatase  46.73 
 
 
336 aa  306  5.0000000000000004e-82  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0281  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  45.62 
 
 
336 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.320713  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3795  fructose-1,6-bisphosphatase  46.08 
 
 
337 aa  302  7.000000000000001e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0445  D-fructose 1,6-bisphosphatase  47.53 
 
 
338 aa  301  9e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.598305  normal  0.101496 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2704  fructose-1,6-bisphosphatase  48.51 
 
 
334 aa  301  1e-80  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1763  fructose-1,6-bisphosphatase  46.73 
 
 
341 aa  301  1e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0106936 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0875  fructose-1,6-bisphosphatase  44.94 
 
 
338 aa  300  2e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0821253  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3263  fructose-1,6-bisphosphatase  45.39 
 
 
335 aa  300  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0139597  hitchhiker  0.00000000837949 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1586  fructose-1,6-bisphosphatase  44.21 
 
 
335 aa  298  6e-80  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1067  fructose-1,6-bisphosphatase  46.73 
 
 
335 aa  299  6e-80  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.641395  normal  0.908963 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0084  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  47.06 
 
 
337 aa  298  7e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2266  fructose-1,6-bisphosphatase  47.04 
 
 
338 aa  295  7e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.014374  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2126  fructose-1,6-bisphosphatase  47.37 
 
 
338 aa  295  9e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1943  fructose-1,6-bisphosphatase  46.71 
 
 
338 aa  294  2e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.713905  normal  0.0350228 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2444  fructose-1,6-bisphosphatase  44.41 
 
 
339 aa  294  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0469  fructose-1,6-bisphosphatase  44.41 
 
 
338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3031  fructose-1,6-bisphosphatase  44.41 
 
 
338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2618  fructose-1,6-bisphosphatase  44.41 
 
 
338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.36  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0990  fructose-1,6-bisphosphatase  44.41 
 
 
338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2925  fructose-1,6-bisphosphatase  44.41 
 
 
338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2987  fructose-1,6-bisphosphatase  44.41 
 
 
338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0157  fructose-1,6-bisphosphatase  44.41 
 
 
338 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1604  fructose-1,6-bisphosphatase  44.44 
 
 
338 aa  289  6e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1511  D-fructose 1,6-bisphosphatase  47.84 
 
 
365 aa  288  8e-77  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422669  decreased coverage  0.0000800022 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2250  fructose-1,6-bisphosphatase  43.03 
 
 
339 aa  288  9e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.523394  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2760  fructose-1,6-bisphosphatase  43.03 
 
 
339 aa  288  1e-76  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.623251  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2944  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  46.5 
 
 
333 aa  287  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1285  D-fructose 1,6-bisphosphatase  45.05 
 
 
333 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.494353  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0889  fructose-1,6-bisphosphatase  46.41 
 
 
339 aa  285  5.999999999999999e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.138169  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0535  fructose-1,6-bisphosphatase  46.73 
 
 
337 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115593  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1014  fructose-1,6-bisphosphatase  46.73 
 
 
337 aa  285  8e-76  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.32393  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0877  fructose-1,6-bisphosphatase  46.41 
 
 
339 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0798323  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1149  fructose-1,6-bisphosphatase  43.03 
 
 
335 aa  285  1.0000000000000001e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.191646  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0423  fructose-1,6-bisphosphatase  45.98 
 
 
336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.93886 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2381  fructose-1,6-bisphosphatase  46.08 
 
 
337 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.881144 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1982  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  47.9 
 
 
364 aa  284  2.0000000000000002e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5090  fructose-1,6-bisphosphatase  45.98 
 
 
336 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0685  fructose-1,6-bisphosphatase  42.9 
 
 
338 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.539737  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0973  fructose-1,6-bisphosphatase  46.41 
 
 
337 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.798772  normal  0.126092 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1393  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  46.71 
 
 
364 aa  283  3.0000000000000004e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.834199  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0669  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  43.57 
 
 
335 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4125  fructose-1,6-bisphosphatase  46.41 
 
 
337 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00362057  normal  0.745504 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2636  D-fructose 1,6-bisphosphatase  47.87 
 
 
333 aa  283  4.0000000000000003e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0412723  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4914  fructose-1,6-bisphosphatase  45.66 
 
 
336 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5843  fructose-1,6-bisphosphatase  45.66 
 
 
336 aa  282  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2577  fructose-1,6-bisphosphatase  42.4 
 
 
337 aa  282  6.000000000000001e-75  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.157967 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2319  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  43.67 
 
 
338 aa  282  6.000000000000001e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.514677  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5040  fructose-1,6-bisphosphatase  45.66 
 
 
336 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2715  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  45.86 
 
 
333 aa  281  8.000000000000001e-75  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3628  fructose-1,6-bisphosphatase  46.3 
 
 
357 aa  281  9e-75  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67490  fructose-1,6-bisphosphatase  45.66 
 
 
336 aa  281  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.309201  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1409  fructose-1,6-bisphosphatase  47.28 
 
 
333 aa  280  2e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1495  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  45.92 
 
 
337 aa  280  2e-74  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000616027  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2403  D-fructose 1,6-bisphosphatase  47.06 
 
 
369 aa  280  2e-74  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.96213  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2450  fructose-1,6-bisphosphatase  43.16 
 
 
378 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.709501  normal  0.535256 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3071  fructose-1,6-bisphosphatase  42.99 
 
 
338 aa  280  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.137108  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45640  fructose-1,6-bisphosphatase  45.98 
 
 
337 aa  280  2e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.191472  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3755  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  46.11 
 
 
365 aa  280  3e-74  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1859  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  47.12 
 
 
334 aa  279  4e-74  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000101477  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1187  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  44.19 
 
 
339 aa  278  8e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.146962 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3266  D-fructose 1,6-bisphosphatase  44.71 
 
 
331 aa  278  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5168  fructose-1,6-bisphosphatase  45.34 
 
 
336 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0370  fructose-1,6-bisphosphatase  45.63 
 
 
336 aa  277  2e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4015  hypothetical protein  47.57 
 
 
331 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3999  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  44.71 
 
 
331 aa  277  2e-73  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.218772  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0021  fructose-1,6-bisphosphatase  44.1 
 
 
335 aa  276  5e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.193201  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0242  fructose-1,6-bisphosphatase  46.08 
 
 
323 aa  276  5e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0389611  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2788  D-fructose 1,6-bisphosphatase  43.06 
 
 
357 aa  275  7e-73  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.450037  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03469  fructose-1,6-bisphosphatase  47.18 
 
 
336 aa  275  8e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3026  Inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  42.65 
 
 
358 aa  274  1.0000000000000001e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00242569  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0920  fructose-1,6-bisphosphatase  42.07 
 
 
338 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.701252  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00214  fructose-1,6-bisphosphatase  44.75 
 
 
325 aa  273  3e-72  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0352  fructose-1,6-bisphosphatase  44.37 
 
 
336 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4138  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  47.24 
 
 
319 aa  273  4.0000000000000004e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000256898  unclonable  0.00000000000522982 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0508  fructose-1,6-bisphosphatase  45.13 
 
 
335 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3013  fructose-1,6-bisphosphatase  45.77 
 
 
322 aa  272  6e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.514687  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0020  fructose-1,6-bisphosphatase  47.32 
 
 
338 aa  272  7e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000687853 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3283  inositol phosphatase/fructose-16-bisphosphatase  41.59 
 
 
343 aa  270  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0347076  normal  0.655 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0821  inositol phosphatase/fructose-1,6-bisphosphatase  45.69 
 
 
355 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.103187  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3770  fructose-1,6-bisphosphatase  43.96 
 
 
329 aa  269  5e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000161659  hitchhiker  0.001107 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0731  fructose-1,6-bisphosphatase  43.81 
 
 
329 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.00000000293174  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3589  D-fructose 1,6-bisphosphatase  46.24 
 
 
338 aa  266  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0270544 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>