24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0691 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0691  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  100 
 
 
160 aa  331  2e-90  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3525  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  58.75 
 
 
160 aa  209  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31037  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3230  hypothetical protein  57.23 
 
 
160 aa  204  5e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4519  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  56.29 
 
 
148 aa  157  6e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331212  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0458  hypothetical protein  49.38 
 
 
160 aa  147  7e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.836098  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3301  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  49.33 
 
 
155 aa  137  4.999999999999999e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5848  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.23 
 
 
168 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0688  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.77 
 
 
163 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1288  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.43 
 
 
149 aa  67  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3253  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  32.14 
 
 
150 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1062  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.77 
 
 
333 aa  60.1  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.429512  normal  0.982781 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4703  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.16 
 
 
155 aa  56.6  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1866  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  30.99 
 
 
157 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2310  hypothetical protein  29.71 
 
 
149 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542995  hitchhiker  0.00649849 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0763  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.67 
 
 
149 aa  51.2  0.000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.169024  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4710  hypothetical protein  30.66 
 
 
157 aa  51.2  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53810  hypothetical protein  30.66 
 
 
157 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.532423  normal  0.693746 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0948  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.28 
 
 
146 aa  48.5  0.00003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000329936  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6293  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.46 
 
 
143 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0739  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.4 
 
 
131 aa  48.1  0.00005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1839  periplasmic protein thiol:disulfide oxidoreductase DsbE  25.19 
 
 
145 aa  43.9  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3868  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  25.56 
 
 
159 aa  42.4  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0853747  normal  0.686212 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  27.54 
 
 
257 aa  42  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4479  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.55 
 
 
146 aa  41.2  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>