15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2310 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2310  hypothetical protein  100 
 
 		 149 aa  305  1.0000000000000001e-82  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542995  hitchhiker  0.00649849 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53810  hypothetical protein  47.97 
 
 		 157 aa  155  1e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.532423  normal  0.693746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4710  hypothetical protein  47.97 
 
 		 157 aa  155  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5848  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  51.39 
 
 		 168 aa  151  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4703  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  46.26 
 
 		 155 aa  145  1.0000000000000001e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0688  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  45.14 
 
 		 163 aa  137  4.999999999999999e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3253  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  41.96 
 
 		 150 aa  136  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1288  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.86 
 
 		 149 aa  129  9e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1062  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.92 
 
 		 333 aa  106  1e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.429512  normal  0.982781 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4519  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  35.82 
 
 		 148 aa  74.7  0.0000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331212  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0458  hypothetical protein  28.1 
 
 		 160 aa  58.9  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.836098  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3301  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  31.69 
 
 		 155 aa  56.2  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0691  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  29.71 
 
 		 160 aa  51.2  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3525  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  28.77 
 
 		 160 aa  47.8  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31037  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3230  hypothetical protein  28.08 
 
 		 160 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.946493 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>