16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_5848 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_5848  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  100 
 
 		 168 aa  338  2e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.580884  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4703  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  59.6 
 
 		 155 aa  188  4e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53810  hypothetical protein  61.22 
 
 		 157 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.532423  normal  0.693746 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4710  hypothetical protein  61.22 
 
 		 157 aa  178  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.380222  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0688  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  54.84 
 
 		 163 aa  170  9e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2310  hypothetical protein  51.39 
 
 		 149 aa  151  5e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.542995  hitchhiker  0.00649849 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1288  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  47.95 
 
 		 149 aa  149  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3253  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  48.97 
 
 		 150 aa  149  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1062  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  44.44 
 
 		 333 aa  124  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.429512  normal  0.982781 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4519  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  39.1 
 
 		 148 aa  86.3  2e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.331212  normal  0.879524 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0458  hypothetical protein  34.39 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.836098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0691  activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  37.23 
 
 		 160 aa  72.4  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3525  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  36.62 
 
 		 160 aa  68.2  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31037  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3301  Activator of Hsp90 ATPase 1 family protein  34.31 
 
 		 155 aa  68.2  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3230  hypothetical protein  37.32 
 
 		 160 aa  66.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.946493 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0572  ArsR family transcriptional regulator  23.61 
 
 		 257 aa  41.6  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>