26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0432 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0432  trimethylamine methyltransferase  100 
 
 		 514 aa  1065    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1775  trimethylamine methyltransferase  57.49 
 
 		 523 aa  577  1.0000000000000001e-163  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.445746  normal  0.0169643 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2813  putative trimethylamine methyltransferase protein  53.95 
 
 		 513 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.94532  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1485  trimethylamine methyltransferase  53.95 
 
 		 513 aa  562  1.0000000000000001e-159  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1716  trimethylamine methyltransferase  53.95 
 
 		 513 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1374  trimethylamine methyltransferase  53.73 
 
 		 514 aa  543  1e-153  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.561281 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1586  trimethylamine methyltransferase  53.42 
 
 		 515 aa  528  1e-149  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.091176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2223  trimethylamine methyltransferase  52.49 
 
 		 519 aa  514  1e-144  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4008  trimethylamine methyltransferase MttB-like protein  41.79 
 
 		 517 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4326  trimethylamine methyltransferase  41.98 
 
 		 476 aa  392  1e-108  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3128  trimethylamine methyltransferase  40.13 
 
 		 519 aa  332  1e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2171  trimethylamine methyltransferase  39.92 
 
 		 519 aa  316  5e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1728  trimethylamine methyltransferase  37.98 
 
 		 468 aa  316  5e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2817  trimethylamine methyltransferase  39.92 
 
 		 519 aa  314  2.9999999999999996e-84  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322933 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5110  trimethylamine methyltransferase  36.66 
 
 		 511 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148591  normal  0.0268 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1480  trimethylamine methyltransferase  33.47 
 
 		 504 aa  241  2e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.246816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1730  trimethylamine methyltransferase  32.05 
 
 		 476 aa  238  2e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4870  trimethylamine methyltransferase  28.36 
 
 		 471 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1467  trimethylamine methyltransferase  30.17 
 
 		 475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.657417  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1111  trimethylamine methyltransferase  24.67 
 
 		 477 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1601  trimethylamine methyltransferase  25.39 
 
 		 510 aa  121  1.9999999999999998e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.38036  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2196  trimethylamine methyltransferase  26.01 
 
 		 515 aa  117  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  0.0249969 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2313  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  22.63 
 
 		 484 aa  108  2e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0209756  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2309  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  27.56 
 
 		 147 aa  52.8  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00021948  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2308  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  32.56 
 
 		 334 aa  51.2  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0038557  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1109  trimethylamine:corrinoid methyltransferase-like protein  22.35 
 
 		 410 aa  49.3  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>