26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbur_2308 on replicon NC_007955
Organism: Methanococcoides burtonii DSM 6242



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007955  Mbur_2308  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  100 
 
 		 334 aa  700    Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0038557  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2313  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  27.9 
 
 		 484 aa  138  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0209756  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1601  trimethylamine methyltransferase  27.5 
 
 		 510 aa  131  1.0000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.38036  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1467  trimethylamine methyltransferase  28.66 
 
 		 475 aa  122  9.999999999999999e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.657417  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2196  trimethylamine methyltransferase  28.05 
 
 		 515 aa  112  7.000000000000001e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  0.0249969 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4870  trimethylamine methyltransferase  27.9 
 
 		 471 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4326  trimethylamine methyltransferase  25.71 
 
 		 476 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1730  trimethylamine methyltransferase  26.95 
 
 		 476 aa  105  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1728  trimethylamine methyltransferase  24.69 
 
 		 468 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5110  trimethylamine methyltransferase  24.37 
 
 		 511 aa  94.4  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148591  normal  0.0268 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1111  trimethylamine methyltransferase  26.37 
 
 		 477 aa  94.4  2e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2171  trimethylamine methyltransferase  25.08 
 
 		 519 aa  81.3  0.00000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1480  trimethylamine methyltransferase  23.53 
 
 		 504 aa  79  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.246816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2817  trimethylamine methyltransferase  27.36 
 
 		 519 aa  73.6  0.000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322933 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1775  trimethylamine methyltransferase  24.21 
 
 		 523 aa  68.9  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.445746  normal  0.0169643 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4008  trimethylamine methyltransferase MttB-like protein  21.79 
 
 		 517 aa  67  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1586  trimethylamine methyltransferase  22.82 
 
 		 515 aa  67  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.091176 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3128  trimethylamine methyltransferase  23.64 
 
 		 519 aa  64.3  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1374  trimethylamine methyltransferase  36.36 
 
 		 514 aa  59.3  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.561281 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1485  trimethylamine methyltransferase  38.96 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1716  trimethylamine methyltransferase  38.96 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2813  putative trimethylamine methyltransferase protein  38.96 
 
 		 513 aa  57.8  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.94532  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1109  trimethylamine:corrinoid methyltransferase-like protein  24.76 
 
 		 410 aa  56.6  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1106  trimethylamine:corrinoid methyltransferase-like protein  31.48 
 
 		 417 aa  53.5  0.000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.491742  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2223  trimethylamine methyltransferase  27.82 
 
 		 519 aa  51.2  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0432  trimethylamine methyltransferase  32.56 
 
 		 514 aa  51.2  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.57949 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>