78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0813 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_0813  protein of unknown function DUF455  100 
 
 
274 aa  548  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.959297 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02503  hypothetical protein  77.7 
 
 
278 aa  434  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.87176  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0932  protein of unknown function DUF455  57.77 
 
 
276 aa  261  6.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0728001  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2112  hypothetical protein  53.91 
 
 
280 aa  261  1e-68  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3130  hypothetical protein  50.9 
 
 
336 aa  259  3e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163589  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2706  hypothetical protein  50.9 
 
 
336 aa  259  3e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1685  hypothetical protein  50.9 
 
 
283 aa  259  4e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0445395  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2484  hypothetical protein  51.49 
 
 
278 aa  258  9e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.881493  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1172  hypothetical protein  51.32 
 
 
285 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000837693 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2626  hypothetical protein  52.69 
 
 
272 aa  256  2e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2188  hypothetical protein  52.69 
 
 
272 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1461  hypothetical protein  52.69 
 
 
272 aa  256  3e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2572  hypothetical protein  52.69 
 
 
276 aa  256  4e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1923  protein of unknown function DUF455  52.55 
 
 
278 aa  254  8e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2139  hypothetical protein  51.54 
 
 
283 aa  254  8e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1899  hypothetical protein  49.82 
 
 
319 aa  253  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5408  hypothetical protein  52 
 
 
285 aa  252  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2012  hypothetical protein  51.79 
 
 
283 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178235 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2102  hypothetical protein  52.38 
 
 
286 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5975  hypothetical protein  52.38 
 
 
286 aa  249  3e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2120  hypothetical protein  52.38 
 
 
286 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5113  hypothetical protein  52.61 
 
 
268 aa  246  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.565314 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3189  hypothetical protein  52.06 
 
 
273 aa  244  9.999999999999999e-64  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1119  hypothetical protein  49.42 
 
 
264 aa  242  5e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0467888  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2555  protein of unknown function DUF455  53.28 
 
 
309 aa  240  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00755068  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3271  hypothetical protein  47.81 
 
 
271 aa  239  4e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1443  hypothetical protein  49.42 
 
 
259 aa  239  5e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0403577  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1042  hypothetical protein  44.24 
 
 
280 aa  238  8e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.839264  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0898  hypothetical protein  44.24 
 
 
280 aa  238  8e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.549388  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0977  protein of unknown function DUF455  55.61 
 
 
294 aa  238  1e-61  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.534107  normal  0.0470434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1073  protein of unknown function DUF455  55.61 
 
 
294 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146686  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1434  hypothetical protein  50 
 
 
284 aa  236  3e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0583  hypothetical protein  51.98 
 
 
276 aa  235  5.0000000000000005e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874814  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1177  hypothetical protein  48.16 
 
 
300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298234  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0883  hypothetical protein  52.4 
 
 
255 aa  233  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1578  hypothetical protein  53.18 
 
 
246 aa  233  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.423953  normal  0.769891 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1060  hypothetical protein  53.42 
 
 
283 aa  231  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1096  hypothetical protein  52.97 
 
 
301 aa  227  1e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1134  hypothetical protein  54.67 
 
 
268 aa  226  3e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1317  hypothetical protein  50 
 
 
276 aa  225  6e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1421  hypothetical protein  43.35 
 
 
265 aa  225  7e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0531  protein of unknown function DUF455  47.25 
 
 
265 aa  223  3e-57  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3453  protein of unknown function DUF455  52.29 
 
 
270 aa  223  3e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2263  hypothetical protein  47.53 
 
 
275 aa  222  6e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1090  hypothetical protein  46.36 
 
 
280 aa  221  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0923  hypothetical protein  47.15 
 
 
275 aa  219  3e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0992  hypothetical protein  47.73 
 
 
268 aa  218  7.999999999999999e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0907  protein of unknown function DUF455  47.35 
 
 
268 aa  216  2.9999999999999998e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1305  hypothetical protein  48.82 
 
 
271 aa  215  5.9999999999999996e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.823956  normal  0.719923 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1406  protein of unknown function DUF455  50.75 
 
 
219 aa  213  2.9999999999999995e-54  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1165  hypothetical protein  50.7 
 
 
277 aa  209  5e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2528  hypothetical protein  45.52 
 
 
275 aa  207  1e-52  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185965  normal  0.122496 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1177  protein of unknown function DUF455  50.45 
 
 
285 aa  206  3e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0199294  normal  0.399239 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1476  hypothetical protein  45.2 
 
 
275 aa  201  9.999999999999999e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444109  normal  0.0249969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2118  protein of unknown function DUF455  45.38 
 
 
275 aa  200  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  decreased coverage  0.00309325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1911  protein of unknown function DUF455  45.82 
 
 
275 aa  199  3e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.489246 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1883  hypothetical protein  49.27 
 
 
260 aa  196  4.0000000000000005e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1152  hypothetical protein  41.04 
 
 
290 aa  185  6e-46  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1053  hypothetical protein  47.71 
 
 
274 aa  182  5.0000000000000004e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108058  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2019  hypothetical protein  54.09 
 
 
161 aa  180  2e-44  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739901  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2183  hypothetical protein  44.92 
 
 
263 aa  179  4e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07364  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  39.49 
 
 
446 aa  179  5.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3914  hypothetical protein  41.89 
 
 
281 aa  177  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3156  hypothetical protein  43.41 
 
 
264 aa  171  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_4617  predicted protein  42.18 
 
 
319 aa  165  8e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116659  normal  0.884452 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0882  hypothetical protein  40.53 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03830  conserved hypothetical protein  36.48 
 
 
546 aa  163  4.0000000000000004e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1089  hypothetical protein  35.6 
 
 
271 aa  157  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1262  hypothetical protein  36.11 
 
 
270 aa  157  2e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0916  hypothetical protein  35 
 
 
270 aa  154  1e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0607  hypothetical protein  32.2 
 
 
265 aa  151  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1131  hypothetical protein  32.95 
 
 
265 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1256  hypothetical protein  32.2 
 
 
265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40450  predicted protein  42.04 
 
 
268 aa  136  5e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.765756  normal  0.016876 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0122  hypothetical protein  47.5 
 
 
117 aa  70.1  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0122  hypothetical protein  47.5 
 
 
117 aa  70.1  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836482  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1412  protein of unknown function DUF455  24.88 
 
 
266 aa  58.2  0.0000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0410117  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2016  hypothetical protein  54.76 
 
 
103 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.375454  normal  0.892159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>