79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1476 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_1476  hypothetical protein  100 
 
 		 275 aa  557  1e-158  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444109  normal  0.0249969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2118  protein of unknown function DUF455  83.02 
 
 		 275 aa  457  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  decreased coverage  0.00309325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1911  protein of unknown function DUF455  82.71 
 
 		 275 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.489246 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1883  hypothetical protein  76.36 
 
 		 260 aa  394  1e-109  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2263  hypothetical protein  68.25 
 
 		 275 aa  392  1e-108  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0923  hypothetical protein  68.25 
 
 		 275 aa  390  1e-107  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3271  hypothetical protein  50.94 
 
 		 271 aa  273  2.0000000000000002e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1177  protein of unknown function DUF455  57.8 
 
 		 285 aa  257  2e-67  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0199294  normal  0.399239 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1090  hypothetical protein  49.43 
 
 		 280 aa  252  4.0000000000000004e-66  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1305  hypothetical protein  50.77 
 
 		 271 aa  244  9.999999999999999e-64  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.823956  normal  0.719923 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2528  hypothetical protein  49.8 
 
 		 275 aa  239  4e-62  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185965  normal  0.122496 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3914  hypothetical protein  52.21 
 
 		 281 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2183  hypothetical protein  52.73 
 
 		 263 aa  225  6e-58  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2112  hypothetical protein  40.6 
 
 		 280 aa  225  7e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1172  hypothetical protein  46.21 
 
 		 285 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000837693 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1923  protein of unknown function DUF455  52.13 
 
 		 278 aa  218  8.999999999999998e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2012  hypothetical protein  51.46 
 
 		 283 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178235 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1119  hypothetical protein  44.94 
 
 		 264 aa  211  9e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0467888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0883  hypothetical protein  43.62 
 
 		 255 aa  211  1e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2139  hypothetical protein  44.88 
 
 		 283 aa  210  2e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1317  hypothetical protein  50.48 
 
 		 276 aa  209  3e-53  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2120  hypothetical protein  45.38 
 
 		 286 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5975  hypothetical protein  45.38 
 
 		 286 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2102  hypothetical protein  45.38 
 
 		 286 aa  208  8e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3156  hypothetical protein  47.35 
 
 		 264 aa  207  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1461  hypothetical protein  43.94 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2706  hypothetical protein  45.1 
 
 		 336 aa  206  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3130  hypothetical protein  45.1 
 
 		 336 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163589  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2188  hypothetical protein  43.94 
 
 		 272 aa  206  3e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0932  protein of unknown function DUF455  46 
 
 		 276 aa  206  3e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0728001  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1578  hypothetical protein  50.97 
 
 		 246 aa  206  4e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.423953  normal  0.769891 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2626  hypothetical protein  43.94 
 
 		 272 aa  206  4e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1685  hypothetical protein  43.94 
 
 		 283 aa  206  4e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0445395  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1060  hypothetical protein  50 
 
 		 283 aa  205  5e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0583  hypothetical protein  46.93 
 
 		 276 aa  205  6e-52  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874814  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5113  hypothetical protein  45 
 
 		 268 aa  205  6e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.565314 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2572  hypothetical protein  48.85 
 
 		 276 aa  205  6e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1434  hypothetical protein  50.72 
 
 		 284 aa  205  7e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5408  hypothetical protein  50.49 
 
 		 285 aa  204  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1443  hypothetical protein  46.86 
 
 		 259 aa  204  1e-51  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0403577  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1899  hypothetical protein  50.72 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1165  hypothetical protein  50.48 
 
 		 277 aa  204  2e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3453  protein of unknown function DUF455  45.29 
 
 		 270 aa  202  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2555  protein of unknown function DUF455  50.49 
 
 		 309 aa  202  4e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00755068  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0977  protein of unknown function DUF455  49.76 
 
 		 294 aa  202  5e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.534107  normal  0.0470434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1073  protein of unknown function DUF455  49.76 
 
 		 294 aa  201  9e-51  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146686  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0813  protein of unknown function DUF455  45.2 
 
 		 274 aa  201  9.999999999999999e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.959297 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0898  hypothetical protein  41.96 
 
 		 280 aa  199  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.549388  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1042  hypothetical protein  41.96 
 
 		 280 aa  199  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.839264  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2484  hypothetical protein  47.55 
 
 		 278 aa  198  7e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.881493  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0907  protein of unknown function DUF455  42.75 
 
 		 268 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0992  hypothetical protein  42.38 
 
 		 268 aa  196  5.000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1134  hypothetical protein  50.24 
 
 		 268 aa  193  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02503  hypothetical protein  43.2 
 
 		 278 aa  192  4e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.87176  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1421  hypothetical protein  39.84 
 
 		 265 aa  192  6e-48  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1096  hypothetical protein  47.34 
 
 		 301 aa  192  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07364  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  41.74 
 
 		 446 aa  189  5e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3189  hypothetical protein  42.05 
 
 		 273 aa  189  5.999999999999999e-47  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0531  protein of unknown function DUF455  44.23 
 
 		 265 aa  189  5.999999999999999e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1177  hypothetical protein  40.3 
 
 		 300 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298234  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03830  conserved hypothetical protein  37.76 
 
 		 546 aa  185  8e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1406  protein of unknown function DUF455  45.45 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1152  hypothetical protein  43.6 
 
 		 290 aa  174  9.999999999999999e-43  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_4617  predicted protein  42.92 
 
 		 319 aa  166  4e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116659  normal  0.884452 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1053  hypothetical protein  39.55 
 
 		 274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108058  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40450  predicted protein  40.52 
 
 		 268 aa  161  8.000000000000001e-39  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.765756  normal  0.016876 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2019  hypothetical protein  47.06 
 
 		 161 aa  144  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739901  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0882  hypothetical protein  36.41 
 
 		 267 aa  132  6e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1089  hypothetical protein  32.47 
 
 		 271 aa  126  4.0000000000000003e-28  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1131  hypothetical protein  30.28 
 
 		 265 aa  126  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0916  hypothetical protein  34.69 
 
 		 270 aa  125  6e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0607  hypothetical protein  34.27 
 
 		 265 aa  124  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1262  hypothetical protein  34.3 
 
 		 270 aa  123  3e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1256  hypothetical protein  33.49 
 
 		 265 aa  121  9.999999999999999e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1412  protein of unknown function DUF455  27.98 
 
 		 266 aa  77  0.0000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0410117  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0122  hypothetical protein  45.95 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0122  hypothetical protein  45.95 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836482  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2016  hypothetical protein  58.54 
 
 		 103 aa  53.5  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.375454  normal  0.892159 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1897  hypothetical protein  29.86 
 
 		 445 aa  50.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000695658  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>