69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1412 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1412  protein of unknown function DUF455  100 
 
 		 266 aa  551  1e-156  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0410117  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1476  hypothetical protein  27.98 
 
 		 275 aa  77  0.0000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444109  normal  0.0249969 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2118  protein of unknown function DUF455  28.12 
 
 		 275 aa  76.6  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  decreased coverage  0.00309325 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1911  protein of unknown function DUF455  27.6 
 
 		 275 aa  75.5  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.489246 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1883  hypothetical protein  31.16 
 
 		 260 aa  74.3  0.000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1421  hypothetical protein  26.85 
 
 		 265 aa  73.6  0.000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2263  hypothetical protein  32.35 
 
 		 275 aa  72.4  0.000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3914  hypothetical protein  27.96 
 
 		 281 aa  72  0.00000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1305  hypothetical protein  31.61 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.823956  normal  0.719923 
 
 
-
 
NC_004310  BR0923  hypothetical protein  32.35 
 
 		 275 aa  69.7  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2572  hypothetical protein  30.18 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2183  hypothetical protein  28.04 
 
 		 263 aa  69.3  0.00000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1685  hypothetical protein  30.18 
 
 		 283 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0445395  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2626  hypothetical protein  30.18 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_4617  predicted protein  31.58 
 
 		 319 aa  69.3  0.00000000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116659  normal  0.884452 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1461  hypothetical protein  30.18 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2188  hypothetical protein  30.18 
 
 		 272 aa  68.9  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1443  hypothetical protein  29.52 
 
 		 259 aa  68.9  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0403577  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1899  hypothetical protein  27.84 
 
 		 319 aa  68.6  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2706  hypothetical protein  30.18 
 
 		 336 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3130  hypothetical protein  30.18 
 
 		 336 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163589  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2139  hypothetical protein  31.25 
 
 		 283 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1172  hypothetical protein  30.12 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000837693 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5408  hypothetical protein  31.25 
 
 		 285 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1434  hypothetical protein  29.35 
 
 		 284 aa  67  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0531  protein of unknown function DUF455  28.57 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2012  hypothetical protein  29.86 
 
 		 283 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00178235 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1923  protein of unknown function DUF455  28.67 
 
 		 278 aa  65.9  0.0000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1177  protein of unknown function DUF455  27.27 
 
 		 285 aa  64.3  0.000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0199294  normal  0.399239 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3271  hypothetical protein  33.09 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2484  hypothetical protein  26.94 
 
 		 278 aa  62.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.881493  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1406  protein of unknown function DUF455  25.45 
 
 		 219 aa  61.6  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2102  hypothetical protein  29.66 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5975  hypothetical protein  29.66 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2120  hypothetical protein  29.66 
 
 		 286 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0932  protein of unknown function DUF455  25.84 
 
 		 276 aa  60.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0728001  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2555  protein of unknown function DUF455  29.86 
 
 		 309 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00755068  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0883  hypothetical protein  26.34 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1578  hypothetical protein  29.86 
 
 		 246 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.423953  normal  0.769891 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1042  hypothetical protein  28.47 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.839264  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0898  hypothetical protein  28.47 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.549388  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3156  hypothetical protein  28.21 
 
 		 264 aa  60.1  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3849  hypothetical protein  26.07 
 
 		 420 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.565023  normal  0.161069 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1060  hypothetical protein  26.42 
 
 		 283 aa  58.9  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1177  hypothetical protein  28.96 
 
 		 300 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1096  hypothetical protein  26.29 
 
 		 301 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0813  protein of unknown function DUF455  24.88 
 
 		 274 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.959297 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0882  hypothetical protein  27.1 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0977  protein of unknown function DUF455  28.39 
 
 		 294 aa  57  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.534107  normal  0.0470434 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1090  hypothetical protein  25 
 
 		 280 aa  56.6  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1119  hypothetical protein  27.08 
 
 		 264 aa  55.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0467888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2112  hypothetical protein  26.95 
 
 		 280 aa  55.8  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2528  hypothetical protein  25.97 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185965  normal  0.122496 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1073  protein of unknown function DUF455  27.74 
 
 		 294 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146686  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5113  hypothetical protein  26.25 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.565314 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1165  hypothetical protein  26.62 
 
 		 277 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02503  hypothetical protein  28.66 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.87176  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2019  hypothetical protein  31.58 
 
 		 161 aa  53.9  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739901  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3189  hypothetical protein  25.33 
 
 		 273 aa  53.5  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03830  conserved hypothetical protein  29.93 
 
 		 546 aa  53.1  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1317  hypothetical protein  25.5 
 
 		 276 aa  52.8  0.000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0916  hypothetical protein  26.67 
 
 		 270 aa  52.4  0.000008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07364  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  26.99 
 
 		 446 aa  50.4  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1897  hypothetical protein  32.37 
 
 		 445 aa  48.5  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000695658  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0583  hypothetical protein  25.36 
 
 		 276 aa  48.1  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874814  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1152  hypothetical protein  27.52 
 
 		 290 aa  47  0.0004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1134  hypothetical protein  28.39 
 
 		 268 aa  46.2  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40450  predicted protein  29.65 
 
 		 268 aa  44.3  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.765756  normal  0.016876 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3453  protein of unknown function DUF455  23.13 
 
 		 270 aa  42.7  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>