78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daro_1119 on replicon NC_007298
Organism: Dechloromonas aromatica RCB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007298  Daro_1119  hypothetical protein  100 
 
 
264 aa  540  9.999999999999999e-153  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0467888  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2626  hypothetical protein  55.47 
 
 
272 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3130  hypothetical protein  55.47 
 
 
336 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.163589  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2706  hypothetical protein  55.47 
 
 
336 aa  269  2.9999999999999997e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1685  hypothetical protein  55.47 
 
 
283 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0445395  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2188  hypothetical protein  55.47 
 
 
272 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1461  hypothetical protein  55.47 
 
 
272 aa  268  5.9999999999999995e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2572  hypothetical protein  55.47 
 
 
276 aa  268  8e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3189  hypothetical protein  56.47 
 
 
273 aa  266  2.9999999999999995e-70  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1177  hypothetical protein  62.62 
 
 
300 aa  264  1e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.298234  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1899  hypothetical protein  53.82 
 
 
319 aa  259  4e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1172  hypothetical protein  61.06 
 
 
285 aa  258  1e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000837693 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2102  hypothetical protein  53.79 
 
 
286 aa  254  7e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5975  hypothetical protein  53.79 
 
 
286 aa  254  7e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1317  hypothetical protein  59.45 
 
 
276 aa  254  8e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0583  hypothetical protein  54.28 
 
 
276 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.874814  normal  0.518394 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2139  hypothetical protein  59.35 
 
 
283 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2112  hypothetical protein  50.2 
 
 
280 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.101925  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2120  hypothetical protein  53.79 
 
 
286 aa  253  2.0000000000000002e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584011 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2012  hypothetical protein  58.41 
 
 
283 aa  252  5.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00178235 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1434  hypothetical protein  59.43 
 
 
284 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0898  hypothetical protein  51.55 
 
 
280 aa  249  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.549388  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1042  hypothetical protein  51.55 
 
 
280 aa  249  3e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.839264  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5113  hypothetical protein  58.74 
 
 
268 aa  248  6e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.565314 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2555  protein of unknown function DUF455  59.43 
 
 
309 aa  248  1e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00755068  normal  0.16298 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5408  hypothetical protein  57.48 
 
 
285 aa  246  4e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0907  protein of unknown function DUF455  58.02 
 
 
268 aa  245  4e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1165  hypothetical protein  57.92 
 
 
277 aa  244  8e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0992  hypothetical protein  58.49 
 
 
268 aa  244  8e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0977  protein of unknown function DUF455  53.33 
 
 
294 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.534107  normal  0.0470434 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1578  hypothetical protein  59.8 
 
 
246 aa  242  3.9999999999999997e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.423953  normal  0.769891 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0813  protein of unknown function DUF455  49.42 
 
 
274 aa  242  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.959297 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3453  protein of unknown function DUF455  56.7 
 
 
270 aa  240  2e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1073  protein of unknown function DUF455  52.33 
 
 
294 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.146686  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1096  hypothetical protein  56.36 
 
 
301 aa  239  2.9999999999999997e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1060  hypothetical protein  56.6 
 
 
283 aa  238  5e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1421  hypothetical protein  50.58 
 
 
265 aa  238  5.999999999999999e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1443  hypothetical protein  50.2 
 
 
259 aa  236  2e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0403577  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02503  hypothetical protein  47.84 
 
 
278 aa  237  2e-61  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.87176  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0531  protein of unknown function DUF455  47.98 
 
 
265 aa  235  5.0000000000000005e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0932  protein of unknown function DUF455  49.03 
 
 
276 aa  233  3e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0728001  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1134  hypothetical protein  54.51 
 
 
268 aa  233  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0883  hypothetical protein  46.56 
 
 
255 aa  230  2e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2484  hypothetical protein  46.99 
 
 
278 aa  221  9e-57  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.881493  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1923  protein of unknown function DUF455  52.34 
 
 
278 aa  219  3e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2263  hypothetical protein  46.56 
 
 
275 aa  218  7e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0923  hypothetical protein  46.15 
 
 
275 aa  214  9.999999999999999e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.935727  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1476  hypothetical protein  44.94 
 
 
275 aa  211  9e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.444109  normal  0.0249969 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1911  protein of unknown function DUF455  43.95 
 
 
275 aa  208  9e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.489246 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1883  hypothetical protein  45.75 
 
 
260 aa  207  2e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2118  protein of unknown function DUF455  43.95 
 
 
275 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.12037  decreased coverage  0.00309325 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3271  hypothetical protein  44.35 
 
 
271 aa  204  1e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1152  hypothetical protein  45.15 
 
 
290 aa  204  1e-51  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1406  protein of unknown function DUF455  50 
 
 
219 aa  201  9.999999999999999e-51  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2019  hypothetical protein  61.25 
 
 
161 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.739901  normal  0.947675 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1090  hypothetical protein  41.54 
 
 
280 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54016  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1053  hypothetical protein  46.92 
 
 
274 aa  185  8e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.108058  normal  0.790191 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3914  hypothetical protein  40.98 
 
 
281 aa  183  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1177  protein of unknown function DUF455  41.96 
 
 
285 aa  181  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0199294  normal  0.399239 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3156  hypothetical protein  42.75 
 
 
264 aa  180  2e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2183  hypothetical protein  45.81 
 
 
263 aa  178  8e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2528  hypothetical protein  38.04 
 
 
275 aa  171  7.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185965  normal  0.122496 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1305  hypothetical protein  39.92 
 
 
271 aa  167  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.823956  normal  0.719923 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0882  hypothetical protein  40.64 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1089  hypothetical protein  35.91 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0916  hypothetical protein  34.73 
 
 
270 aa  150  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0607  hypothetical protein  33.57 
 
 
265 aa  149  4e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1131  hypothetical protein  33.21 
 
 
265 aa  149  5e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1256  hypothetical protein  33.21 
 
 
265 aa  148  1.0000000000000001e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1262  hypothetical protein  35.62 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07364  beta-1,4-xylosidase (Eurofung)  33.96 
 
 
446 aa  145  6e-34  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_4617  predicted protein  37.02 
 
 
319 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.116659  normal  0.884452 
 
 
-
 
NC_006694  CNI03830  conserved hypothetical protein  36.53 
 
 
546 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40450  predicted protein  35.5 
 
 
268 aa  108  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.765756  normal  0.016876 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1412  protein of unknown function DUF455  27.08 
 
 
266 aa  55.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0410117  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0122  hypothetical protein  50.85 
 
 
117 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836482  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0122  hypothetical protein  50.85 
 
 
117 aa  55.1  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2016  hypothetical protein  63.41 
 
 
103 aa  52  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.375454  normal  0.892159 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>