17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_18930 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_18930  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  100 
 
 		 282 aa  521  1e-147  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.401268  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0650  UbiA prenyltransferase  53.49 
 
 		 282 aa  154  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1161  UbiA prenyltransferase  55.1 
 
 		 291 aa  148  8e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.786888  hitchhiker  0.00393924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0148  UbiA prenyltransferase  44.49 
 
 		 258 aa  144  2e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4393  UbiA prenyltransferase  46.48 
 
 		 290 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20380  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  49.21 
 
 		 271 aa  141  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.125338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5114  UbiA prenyltransferase  50.26 
 
 		 263 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5948  hypothetical protein  46.28 
 
 		 301 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.720935  normal  0.0319733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2105  UbiA prenyltransferase  39.9 
 
 		 270 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.481967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4697  UbiA prenyltransferase  41.88 
 
 		 303 aa  105  8e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.232584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4267  UbiA prenyltransferase  42.93 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3992  UbiA prenyltransferase  44.1 
 
 		 273 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal  0.560711 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00490  hypothetical protein  41.23 
 
 		 264 aa  88.2  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.295551  normal  0.866332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4041  hypothetical protein  31.25 
 
 		 290 aa  60.5  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0165  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.76 
 
 		 303 aa  57  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04901  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.57 
 
 		 315 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3664  1,4-dihydroxy-2-naphtoate prenyltransferase  30.65 
 
 		 290 aa  42  0.01  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>