16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5948 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5948  hypothetical protein  100 
 
 		 301 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.720935  normal  0.0319733 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4393  UbiA prenyltransferase  51 
 
 		 290 aa  211  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20380  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  63.3 
 
 		 271 aa  178  1e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.125338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2105  UbiA prenyltransferase  43.75 
 
 		 270 aa  162  8.000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.481967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0148  UbiA prenyltransferase  47.89 
 
 		 258 aa  145  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5114  UbiA prenyltransferase  56.19 
 
 		 263 aa  145  9e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1161  UbiA prenyltransferase  57.21 
 
 		 291 aa  142  7e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.786888  hitchhiker  0.00393924 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4697  UbiA prenyltransferase  51.02 
 
 		 303 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.232584 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18930  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  46.28 
 
 		 282 aa  128  1.0000000000000001e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.401268  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0650  UbiA prenyltransferase  49.12 
 
 		 282 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3992  UbiA prenyltransferase  55.56 
 
 		 273 aa  124  1e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal  0.560711 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4267  UbiA prenyltransferase  50.26 
 
 		 310 aa  119  7e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4041  hypothetical protein  37.44 
 
 		 290 aa  98.2  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00490  hypothetical protein  44.25 
 
 		 264 aa  96.7  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.295551  normal  0.866332 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0527  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  29.19 
 
 		 292 aa  45.1  0.002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0079711 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0165  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.16 
 
 		 303 aa  42.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>