29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5114 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5114  UbiA prenyltransferase  100 
 
 		 263 aa  486  1e-136  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4393  UbiA prenyltransferase  47.88 
 
 		 290 aa  178  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20380  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  54.82 
 
 		 271 aa  166  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.125338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1161  UbiA prenyltransferase  62.05 
 
 		 291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.786888  hitchhiker  0.00393924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5948  hypothetical protein  55.02 
 
 		 301 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.720935  normal  0.0319733 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2105  UbiA prenyltransferase  44.44 
 
 		 270 aa  152  4e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.481967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18930  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  50.26 
 
 		 282 aa  152  5.9999999999999996e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.401268  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0650  UbiA prenyltransferase  54.98 
 
 		 282 aa  150  2e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0148  UbiA prenyltransferase  45.38 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4697  UbiA prenyltransferase  45.64 
 
 		 303 aa  122  4e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.232584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4267  UbiA prenyltransferase  40.37 
 
 		 310 aa  122  9e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3992  UbiA prenyltransferase  47.92 
 
 		 273 aa  112  6e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal  0.560711 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4041  hypothetical protein  41.38 
 
 		 290 aa  102  9e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00490  hypothetical protein  49.03 
 
 		 264 aa  87  2e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.295551  normal  0.866332 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0165  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.79 
 
 		 303 aa  56.2  0.0000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0279  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.33 
 
 		 302 aa  55.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0728517  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1016  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.31 
 
 		 302 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1922  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.33 
 
 		 302 aa  53.1  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4820  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.65 
 
 		 295 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3747  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.31 
 
 		 297 aa  48.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  31.98 
 
 		 274 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5287  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.65 
 
 		 295 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.111529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2360  bacteriochlorophyll c synthase  25.25 
 
 		 333 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.663632  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1933  (S)-2,3-di-O-geranylgeranylglyceryl phosphate synthase  40 
 
 		 284 aa  45.4  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0238  bacteriochlorophyll c synthase  23.5 
 
 		 334 aa  43.5  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.325704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2172  bacteriochlorophyll c synthase  26.96 
 
 		 333 aa  43.1  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1088  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase, putative  28.5 
 
 		 284 aa  42.4  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0563652  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1733  UbiA prenyltransferase  39.44 
 
 		 276 aa  42.4  0.008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1142  UbiA prenyltransferase  28.22 
 
 		 267 aa  42  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>