34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4267 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4267  UbiA prenyltransferase  100 
 
 		 310 aa  570  1e-161  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4697  UbiA prenyltransferase  84.42 
 
 		 303 aa  362  4e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.232584 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4393  UbiA prenyltransferase  45.49 
 
 		 290 aa  164  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20380  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  56.35 
 
 		 271 aa  159  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.125338  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1161  UbiA prenyltransferase  52.97 
 
 		 291 aa  144  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.786888  hitchhiker  0.00393924 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0148  UbiA prenyltransferase  50 
 
 		 258 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2105  UbiA prenyltransferase  37.96 
 
 		 270 aa  131  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.481967  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5948  hypothetical protein  49.06 
 
 		 301 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.720935  normal  0.0319733 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0650  UbiA prenyltransferase  48.43 
 
 		 282 aa  120  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5114  UbiA prenyltransferase  48.17 
 
 		 263 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18930  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  43.68 
 
 		 282 aa  112  9e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.401268  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3992  UbiA prenyltransferase  43.68 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal  0.560711 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00490  hypothetical protein  42.68 
 
 		 264 aa  75.9  0.0000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.295551  normal  0.866332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4041  hypothetical protein  32.88 
 
 		 290 aa  64.3  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2330  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  35.21 
 
 		 295 aa  49.7  0.00007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.417297 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1719  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.38 
 
 		 297 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.641378  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3992  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.88 
 
 		 306 aa  47.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0429  UbiA prenyltransferase  34.72 
 
 		 292 aa  47.4  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.270535  normal  0.910101 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0439  prenyltransferase  26.21 
 
 		 298 aa  47.4  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1016  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.05 
 
 		 302 aa  46.6  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3747  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.38 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1922  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.88 
 
 		 302 aa  45.4  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  26.98 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0824  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  26.69 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129328  normal  0.188314 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0279  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.44 
 
 		 302 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0728517  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1609  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  27.23 
 
 		 307 aa  43.5  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0627  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.41 
 
 		 303 aa  43.1  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4820  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.18 
 
 		 295 aa  42.7  0.008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0428449 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0371  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  28.24 
 
 		 290 aa  42.7  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.156009  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0380  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.24 
 
 		 290 aa  42.7  0.008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3393  prenyltransferase  27.21 
 
 		 298 aa  42.7  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.604924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.92 
 
 		 274 aa  42.7  0.009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1494  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  29.17 
 
 		 308 aa  42.4  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0967574 
 
 
-
 
NC_004310  BR0415  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  31.25 
 
 		 333 aa  42.4  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.638328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>