49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4697 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4697  UbiA prenyltransferase  100 
 
 		 303 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.232584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4267  UbiA prenyltransferase  84.42 
 
 		 310 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4393  UbiA prenyltransferase  47.39 
 
 		 290 aa  177  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20380  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  56.35 
 
 		 271 aa  159  8e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.125338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2105  UbiA prenyltransferase  40.36 
 
 		 270 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.481967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1161  UbiA prenyltransferase  51.03 
 
 		 291 aa  139  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.786888  hitchhiker  0.00393924 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5948  hypothetical protein  49.77 
 
 		 301 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.720935  normal  0.0319733 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0148  UbiA prenyltransferase  43.49 
 
 		 258 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0650  UbiA prenyltransferase  47.73 
 
 		 282 aa  121  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5114  UbiA prenyltransferase  47.18 
 
 		 263 aa  119  9e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18930  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  43.75 
 
 		 282 aa  112  8.000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.401268  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3992  UbiA prenyltransferase  43.68 
 
 		 273 aa  90.5  3e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal  0.560711 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00490  hypothetical protein  44.58 
 
 		 264 aa  84.3  0.000000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.295551  normal  0.866332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4041  hypothetical protein  33.48 
 
 		 290 aa  65.1  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3401  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.72 
 
 		 287 aa  51.6  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0380  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  31.75 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0371  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  31.75 
 
 		 290 aa  50.4  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.156009  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3992  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.63 
 
 		 306 aa  50.1  0.00004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.243579 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0439  prenyltransferase  31.33 
 
 		 298 aa  50.4  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1016  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  30.62 
 
 		 297 aa  50.1  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1719  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30 
 
 		 297 aa  49.7  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.641378  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2421  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.19 
 
 		 284 aa  49.7  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.755837  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3393  prenyltransferase  29.45 
 
 		 298 aa  49.3  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.604924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1922  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.48 
 
 		 302 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1693  prenyltransferase  28.57 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00802705  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1016  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.44 
 
 		 302 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1494  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  30.77 
 
 		 308 aa  46.6  0.0005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0967574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3747  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.98 
 
 		 297 aa  46.6  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138219 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1302  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  30.86 
 
 		 303 aa  46.2  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2438  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.89 
 
 		 293 aa  46.2  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.160291 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0279  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  27.44 
 
 		 302 aa  45.1  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0728517  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0824  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  28.57 
 
 		 316 aa  45.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.129328  normal  0.188314 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0965  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.66 
 
 		 299 aa  45.1  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.271339  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4497  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  24.57 
 
 		 286 aa  44.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0633254  normal  0.801833 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0482  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.31 
 
 		 315 aa  45.1  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.398255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1609  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  25.89 
 
 		 307 aa  43.9  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5365  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.83 
 
 		 274 aa  43.5  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0827781  normal  0.24577 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0469  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  25 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3527  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.3 
 
 		 294 aa  43.5  0.004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0636  prenyltransferase  27.78 
 
 		 277 aa  43.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0140  4-hydroxybenzoate polyprenyl transferase  27.01 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.654949  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2048  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase  27.01 
 
 		 287 aa  43.1  0.006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0232  prenyltransferase  26.26 
 
 		 289 aa  42.7  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1732  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  26.04 
 
 		 309 aa  42.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1904  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  30.27 
 
 		 284 aa  42.7  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103597  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2101  UbiA prenyltransferase  30.89 
 
 		 311 aa  42.7  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0486662  normal  0.010444 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0216  prenyltransferase  27.4 
 
 		 289 aa  42.7  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0492  prenyltransferase  24.86 
 
 		 302 aa  42.7  0.008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.203515  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0627  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.25 
 
 		 303 aa  42.4  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.916979  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>