29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0650 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0650  UbiA prenyltransferase  100 
 
 
282 aa  503  1e-141  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18930  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  54.59 
 
 
282 aa  171  7.999999999999999e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.401268  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1161  UbiA prenyltransferase  59.7 
 
 
291 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.786888  hitchhiker  0.00393924 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4393  UbiA prenyltransferase  45.35 
 
 
290 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5114  UbiA prenyltransferase  55.9 
 
 
263 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20380  4-hydroxybenzoate polyprenyltransferase-like prenyltransferase  52.6 
 
 
271 aa  142  7e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.125338  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2105  UbiA prenyltransferase  39.42 
 
 
270 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.481967  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5948  hypothetical protein  50.5 
 
 
301 aa  132  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.720935  normal  0.0319733 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4697  UbiA prenyltransferase  42.96 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.232584 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3992  UbiA prenyltransferase  52.31 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.397664  normal  0.560711 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0148  UbiA prenyltransferase  43.17 
 
 
258 aa  129  7.000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.617501 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4267  UbiA prenyltransferase  42.22 
 
 
310 aa  126  4.0000000000000003e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.421477 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00490  hypothetical protein  43.56 
 
 
264 aa  88.6  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.295551  normal  0.866332 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4041  hypothetical protein  33.83 
 
 
290 aa  63.5  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1286  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  30.73 
 
 
310 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1733  UbiA prenyltransferase  27.01 
 
 
276 aa  46.2  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0958  UbiA prenyltransferase  27.06 
 
 
294 aa  45.8  0.0008  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3350  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.69 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2686  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.32 
 
 
291 aa  45.4  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.179925 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3316  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.69 
 
 
287 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2396  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.17 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.38401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2582  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.17 
 
 
287 aa  44.3  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3361  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.17 
 
 
316 aa  44.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.230126  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0312  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.17 
 
 
370 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1173  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  29.17 
 
 
370 aa  44.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2509  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  27.92 
 
 
291 aa  43.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3815  4-hydroxybenzoate octaprenyltransferase  28.5 
 
 
287 aa  42.7  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.471745  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1719  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  28.05 
 
 
297 aa  42.7  0.007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.641378  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3992  bacteriochlorophyll/chlorophyll a synthase  29.86 
 
 
306 aa  42.4  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.243579 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>