268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3397 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_3397  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
156 aa  313  5e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00567056  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0451  GCN5-related N-acetyltransferase  70.55 
 
 
152 aa  219  8e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0454  GCN5-related N-acetyltransferase  66.67 
 
 
151 aa  208  2e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0501  GCN5-related N-acetyltransferase  68.67 
 
 
154 aa  209  2e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.077334  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4523  GCN5-related N-acetyltransferase  65.31 
 
 
151 aa  207  5e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0916694 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0525  GCN5-related N-acetyltransferase  61.9 
 
 
157 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3507  GCN5-related N-acetyltransferase  61.9 
 
 
157 aa  199  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3967  GCN5-related N-acetyltransferase  62.33 
 
 
151 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0484  GCN5-related N-acetyltransferase  62.33 
 
 
151 aa  198  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0526  acetyltransferase  60.54 
 
 
157 aa  197  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3785  GCN5-related N-acetyltransferase  62.33 
 
 
151 aa  198  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  61.9 
 
 
157 aa  197  5e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3338  GCN5-related N-acetyltransferase  61.64 
 
 
151 aa  197  6e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3841  GCN5-related N-acetyltransferase  61.64 
 
 
151 aa  196  9e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  60.81 
 
 
154 aa  193  7e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.451908  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0404  acetyltransferase  60.96 
 
 
152 aa  184  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02345  elaA protein  54.79 
 
 
151 aa  171  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.965986  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2142  acetyltransferase  54.79 
 
 
149 aa  169  1e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000170191  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2648  GCN5-related N-acetyltransferase  54.05 
 
 
150 aa  167  6e-41  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.15426 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0409  putative acetyltransferase  50 
 
 
150 aa  158  3e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0583374  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00761  hypothetical protein  51.37 
 
 
150 aa  156  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001712  ElaA protein  48.03 
 
 
171 aa  153  9e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00148635  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3899  acetyltransferase  50.65 
 
 
159 aa  150  8.999999999999999e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  decreased coverage  0.000678102  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1430  GCN5-related N-acetyltransferase  49.31 
 
 
155 aa  143  8.000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.130304  normal  0.895878 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04268  ElaA  47.62 
 
 
158 aa  142  1e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.099656  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0161  GCN5-related N-acetyltransferase  42.95 
 
 
152 aa  138  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0647025  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0512  GCN5-related N-acetyltransferase  44.59 
 
 
152 aa  137  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1849  GCN5-related N-acetyltransferase  46.26 
 
 
149 aa  137  7e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.524385 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02194  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  45.21 
 
 
153 aa  135  1e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1390  GCN5-related N-acetyltransferase  45.21 
 
 
153 aa  135  1e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.205468  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5011  acetyltransferase, GNAT family  43.92 
 
 
152 aa  136  1e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2564  hypothetical protein  45.21 
 
 
153 aa  135  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.285519  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1381  hypothetical protein  45.21 
 
 
153 aa  135  1e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.836873 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02153  hypothetical protein  45.21 
 
 
153 aa  135  1e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.963102  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2413  hypothetical protein  45.21 
 
 
153 aa  135  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.60125  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2489  GCN5-related N-acetyltransferase  46.01 
 
 
164 aa  135  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3409  hypothetical protein  44.52 
 
 
153 aa  135  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.242076  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2646  hypothetical protein  45.21 
 
 
153 aa  135  2e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.236259  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2422  hypothetical protein  45.21 
 
 
153 aa  135  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.527979  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1876  GCN5-related N-acetyltransferase  50.35 
 
 
161 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.740405  normal  0.0653967 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2817  hypothetical protein  42.47 
 
 
154 aa  132  1.9999999999999998e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.665417 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2507  acetyltransferase protein  48.37 
 
 
158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3615  GCN5-related N-acetyltransferase  42.95 
 
 
151 aa  130  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2020  GCN5-related N-acetyltransferase  46.26 
 
 
152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00823373  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2562  GCN5-related N-acetyltransferase  46.94 
 
 
150 aa  129  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.459668  normal  0.179333 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3461  GCN5-related N-acetyltransferase  41.61 
 
 
151 aa  127  7.000000000000001e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5005  GCN5-related N-acetyltransferase  43.05 
 
 
150 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167967  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0143  GCN5-related N-acetyltransferase  47.74 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0550185  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  46.58 
 
 
194 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.420714 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2450  GCN5-related N-acetyltransferase  47.52 
 
 
146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.325798  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4518  GCN5-related N-acetyltransferase  44.52 
 
 
149 aa  123  1e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0190  hypothetical protein  42.57 
 
 
150 aa  121  4e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03440  probable acetyltransferase YybD  42.55 
 
 
147 aa  120  5e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.149506  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5252  GCN5-related N-acetyltransferase  41.89 
 
 
150 aa  120  6e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0415  acetyltransferase  42.18 
 
 
142 aa  120  8e-27  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0129  acetyltransferase  46.67 
 
 
155 aa  120  8e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2870  GCN5-related N-acetyltransferase  44.14 
 
 
156 aa  119  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.495328  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01400  hypothetical protein  41.89 
 
 
150 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1069  acetyltransferase  42.18 
 
 
149 aa  118  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1856  GCN5-related N-acetyltransferase  40.67 
 
 
155 aa  118  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2520  hypothetical protein  40.54 
 
 
148 aa  117  7.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2552  hypothetical protein  44.52 
 
 
153 aa  116  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.963388 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2652  GCN5-related N-acetyltransferase  42.47 
 
 
155 aa  116  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0752  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
151 aa  116  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.78216  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1698  GCN5-related N-acetyltransferase  42.67 
 
 
154 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.878783 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3298  GCN5-related N-acetyltransferase  44.68 
 
 
148 aa  115  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.181842  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2005  GCN5-related N-acetyltransferase  42.67 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.216464  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  41.78 
 
 
145 aa  114  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0566  GCN5-related N-acetyltransferase  39.47 
 
 
152 aa  114  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2656  hypothetical protein  43.84 
 
 
153 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.483858  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2448  hypothetical protein  43.84 
 
 
153 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.60595  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2373  hypothetical protein  40.54 
 
 
152 aa  114  6e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2498  hypothetical protein  43.84 
 
 
153 aa  114  6e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.705212  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10100  predicted acyltransferase  46.48 
 
 
150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.374622  normal  0.768267 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0768  GCN5-related N-acetyltransferase  42.36 
 
 
158 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.474283  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2540  hypothetical protein  43.84 
 
 
153 aa  113  7.999999999999999e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.131258  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4265  GCN5-related N-acetyltransferase  41.38 
 
 
161 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.439553  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1129  GCN5-related N-acetyltransferase  40.28 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0674  GCN5-related N-acetyltransferase  39.19 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1153  GCN5-related N-acetyltransferase  39.19 
 
 
163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1035  GCN5-related N-acetyltransferase  40.67 
 
 
163 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.292838  normal  0.55211 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1031  GCN5-related N-acetyltransferase  40.67 
 
 
163 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1771  acetyltransferase  38.51 
 
 
176 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.290563  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2833  acetyltransferase  38.51 
 
 
176 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.674293  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2448  acetyltransferase  38.51 
 
 
176 aa  110  9e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0561  acetyltransferase  38 
 
 
167 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2876  acetyltransferase  38.51 
 
 
222 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2021  GCN5-related N-acetyltransferase  41.84 
 
 
147 aa  109  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000198692  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2152  GCN5-related N-acetyltransferase  40.28 
 
 
163 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0827437  normal  0.735996 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2761  acetyltransferase  38.51 
 
 
225 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.326782  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5865  GCN5-related N-acetyltransferase  48.55 
 
 
150 aa  108  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2820  acetyltransferase  38.51 
 
 
225 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.91191  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1748  acetyltransferase  38.36 
 
 
182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396141  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1303  GCN5-related N-acetyltransferase  42.38 
 
 
196 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1202  GCN5-related N-acetyltransferase  38.31 
 
 
196 aa  106  1e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2885  GCN5-related N-acetyltransferase  39.04 
 
 
164 aa  105  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.502905 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0854  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 
166 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1116  acetyltransferase  41.72 
 
 
196 aa  102  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3651  GCN5-related N-acetyltransferase  46.1 
 
 
285 aa  103  1e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0841682  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4956  acetyltransferase  37.75 
 
 
150 aa  102  2e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>