21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_2222 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_2222  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  236  8e-62  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163022  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2891  hypothetical protein  85.34 
 
 		 118 aa  205  1e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1562  hypothetical protein  85.22 
 
 		 118 aa  205  2e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1637  hypothetical protein  85.22 
 
 		 118 aa  205  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.681194  normal  0.0365332 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1629  hypothetical protein  85.22 
 
 		 118 aa  205  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.192073  normal  0.122976 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2512  hypothetical protein  81.74 
 
 		 118 aa  200  6e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1810  hypothetical protein  81.74 
 
 		 118 aa  200  6e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586004  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1773  hypothetical protein  81.74 
 
 		 118 aa  200  6e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1766  hypothetical protein  81.74 
 
 		 118 aa  200  6e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.045673  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2604  hypothetical protein  81.58 
 
 		 118 aa  197  5e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.510328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1652  hypothetical protein  80.7 
 
 		 117 aa  195  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.582788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2475  hypothetical protein  79.31 
 
 		 117 aa  193  7e-49  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0013472  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1705  hypothetical protein  80.18 
 
 		 116 aa  191  2e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507037  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1958  hypothetical protein  78.45 
 
 		 116 aa  189  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.323236  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2274  hypothetical protein  78.38 
 
 		 116 aa  186  7e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000351177  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2062  hypothetical protein  78.07 
 
 		 116 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0632  hypothetical protein  61.95 
 
 		 114 aa  136  7.999999999999999e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1386  hypothetical protein  44.44 
 
 		 111 aa  89.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0266268  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02242  hypothetical protein  38.39 
 
 		 114 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003518  type IIA topoisomerase B subunit  38.39 
 
 		 114 aa  81.6  0.000000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000017095  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1143  hypothetical protein  35.4 
 
 		 143 aa  77  0.00000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00345292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>