21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1562 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1562  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  243  8e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1637  hypothetical protein  100 
 
 		 118 aa  243  8e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.681194  normal  0.0365332 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1629  hypothetical protein  99.15 
 
 		 118 aa  240  6e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.192073  normal  0.122976 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2891  hypothetical protein  96.61 
 
 		 118 aa  236  1e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2512  hypothetical protein  89.83 
 
 		 118 aa  221  3e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1810  hypothetical protein  89.83 
 
 		 118 aa  221  3e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586004  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1766  hypothetical protein  89.83 
 
 		 118 aa  221  3e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.045673  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1652  hypothetical protein  92.98 
 
 		 117 aa  220  6e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.582788  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1773  hypothetical protein  90.52 
 
 		 118 aa  219  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2222  hypothetical protein  85.22 
 
 		 116 aa  205  2e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163022  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2604  hypothetical protein  83.33 
 
 		 118 aa  204  4e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.510328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1705  hypothetical protein  81.08 
 
 		 116 aa  193  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507037  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1958  hypothetical protein  78.95 
 
 		 116 aa  192  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.323236  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2062  hypothetical protein  79.31 
 
 		 116 aa  191  4e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2274  hypothetical protein  78.38 
 
 		 116 aa  189  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000351177  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2475  hypothetical protein  77.19 
 
 		 117 aa  187  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0013472  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0632  hypothetical protein  58.41 
 
 		 114 aa  129  1.0000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1386  hypothetical protein  44.44 
 
 		 111 aa  90.9  6e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0266268  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02242  hypothetical protein  36.61 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003518  type IIA topoisomerase B subunit  37.5 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000017095  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1143  hypothetical protein  35.09 
 
 		 143 aa  72.8  0.000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00345292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>