21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_2475 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_2475  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  239  7e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0013472  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2222  hypothetical protein  79.31 
 
 
116 aa  193  7e-49  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163022  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1562  hypothetical protein  77.19 
 
 
118 aa  187  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1637  hypothetical protein  77.19 
 
 
118 aa  187  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.681194  normal  0.0365332 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1773  hypothetical protein  76.99 
 
 
118 aa  186  9e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2512  hypothetical protein  76.99 
 
 
118 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1629  hypothetical protein  76.32 
 
 
118 aa  186  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.192073  normal  0.122976 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1810  hypothetical protein  76.99 
 
 
118 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586004  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1766  hypothetical protein  76.99 
 
 
118 aa  186  1e-46  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.045673  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2891  hypothetical protein  75.86 
 
 
118 aa  184  3e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1705  hypothetical protein  76.32 
 
 
116 aa  184  3e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507037  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1958  hypothetical protein  75 
 
 
116 aa  183  7e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.323236  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1652  hypothetical protein  76.32 
 
 
117 aa  181  3e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.582788  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2604  hypothetical protein  74.56 
 
 
118 aa  181  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.510328  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2274  hypothetical protein  74.56 
 
 
116 aa  181  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000351177  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2062  hypothetical protein  76.32 
 
 
116 aa  178  2e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0632  hypothetical protein  59.29 
 
 
114 aa  132  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1386  hypothetical protein  48.15 
 
 
111 aa  94.4  4e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0266268  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02242  hypothetical protein  40.18 
 
 
114 aa  82.8  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003518  type IIA topoisomerase B subunit  40.18 
 
 
114 aa  80.5  0.000000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000017095  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1143  hypothetical protein  36.28 
 
 
143 aa  77.4  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00345292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>