21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_1705 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_1705  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  236  5.999999999999999e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.507037  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2604  hypothetical protein  79.13 
 
 		 118 aa  194  3e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.510328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1562  hypothetical protein  81.08 
 
 		 118 aa  193  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1637  hypothetical protein  81.08 
 
 		 118 aa  193  5.000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.681194  normal  0.0365332 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1773  hypothetical protein  80.18 
 
 		 118 aa  194  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2512  hypothetical protein  80.18 
 
 		 118 aa  193  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1810  hypothetical protein  80.18 
 
 		 118 aa  193  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.586004  normal  0.941968 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1766  hypothetical protein  80.18 
 
 		 118 aa  193  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.045673  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1629  hypothetical protein  81.08 
 
 		 118 aa  193  6e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.192073  normal  0.122976 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2274  hypothetical protein  77.59 
 
 		 116 aa  192  1e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000351177  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2891  hypothetical protein  81.08 
 
 		 118 aa  192  2e-48  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2222  hypothetical protein  80.18 
 
 		 116 aa  191  2e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163022  normal  0.071447 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1958  hypothetical protein  79.82 
 
 		 116 aa  189  9e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.323236  normal  0.342733 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1652  hypothetical protein  75.44 
 
 		 117 aa  186  1e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.582788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2475  hypothetical protein  76.32 
 
 		 117 aa  184  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0013472  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2062  hypothetical protein  75.65 
 
 		 116 aa  182  1.0000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0632  hypothetical protein  62.04 
 
 		 114 aa  135  3.0000000000000003e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1386  hypothetical protein  45.37 
 
 		 111 aa  92.8  1e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0266268  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02242  hypothetical protein  36.94 
 
 		 114 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003518  type IIA topoisomerase B subunit  36.94 
 
 		 114 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000017095  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1143  hypothetical protein  36.04 
 
 		 143 aa  76.3  0.0000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00345292  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>