38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1133 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_1133  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  295  2e-79  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000664449  normal  0.51318 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1228  hypothetical protein  74.31 
 
 		 144 aa  233  8e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000394867  normal  0.28109 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1123  hypothetical protein  75 
 
 		 144 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000274951  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1189  hypothetical protein  74.31 
 
 		 144 aa  230  5e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1260  hypothetical protein  74.31 
 
 		 144 aa  230  5e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0719621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1190  hypothetical protein  74.31 
 
 		 144 aa  230  6e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.201657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1328  hypothetical protein  77.08 
 
 		 144 aa  229  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762058 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3029  hypothetical protein  74.31 
 
 		 144 aa  228  2e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00182183  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3357  hypothetical protein  73.61 
 
 		 144 aa  227  3e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3044  hypothetical protein  74.31 
 
 		 144 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000942891  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1334  hypothetical protein  74.31 
 
 		 144 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000385452  hitchhiker  0.0000682946 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3187  hypothetical protein  74.31 
 
 		 144 aa  228  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000444693  normal  0.170187 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2691  hypothetical protein  72.92 
 
 		 144 aa  223  6e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.572977  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2481  hypothetical protein  73.61 
 
 		 144 aa  222  2e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.330818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2864  hypothetical protein  78.36 
 
 		 153 aa  221  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0248676  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2685  hypothetical protein  69.13 
 
 		 149 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188412  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3666  hypothetical protein  52.14 
 
 		 146 aa  145  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0539  hypothetical protein  51.69 
 
 		 143 aa  128  3e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.703361  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03582  hypothetical protein  46.77 
 
 		 143 aa  127  3e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3721  hypothetical protein  49.64 
 
 		 134 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002452  hypothetical protein  45.97 
 
 		 143 aa  127  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0009  hypothetical protein  42.86 
 
 		 143 aa  120  7e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03301  hypothetical protein  44.88 
 
 		 173 aa  119  9.999999999999999e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3044  hypothetical protein  46.48 
 
 		 146 aa  113  7.999999999999999e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.766056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5325  hypothetical protein  37.76 
 
 		 144 aa  90.5  7e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4157  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  86.3  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03020  hypothetical protein  37.3 
 
 		 139 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2425  hypothetical protein  28.97 
 
 		 150 aa  85.1  3e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2922  hypothetical protein  32.64 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1677  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0251  hypothetical protein  30.28 
 
 		 142 aa  78.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4972  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5149  hypothetical protein  34.07 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.627977 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5099  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.403368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0530  hypothetical protein  27.08 
 
 		 150 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3646  ribosomal protein L28  30.47 
 
 		 146 aa  74.3  0.0000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0366  hypothetical protein  32.84 
 
 		 144 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0487  hypothetical protein  28.06 
 
 		 139 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05060  hypothetical protein  28.06 
 
 		 139 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>