38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal_3029 on replicon NC_009052
Organism: Shewanella baltica OS155



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_3029  hypothetical protein  100 
 
 
144 aa  295  1e-79  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00182183  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3044  hypothetical protein  99.31 
 
 
144 aa  293  5e-79  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000942891  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3187  hypothetical protein  99.31 
 
 
144 aa  293  5e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000444693  normal  0.170187 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1334  hypothetical protein  99.31 
 
 
144 aa  293  5e-79  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000385452  hitchhiker  0.0000682946 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1189  hypothetical protein  90.28 
 
 
144 aa  270  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177556  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1260  hypothetical protein  90.28 
 
 
144 aa  270  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0719621  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1190  hypothetical protein  89.58 
 
 
144 aa  270  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.201657  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3357  hypothetical protein  88.89 
 
 
144 aa  265  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2691  hypothetical protein  84.03 
 
 
144 aa  259  6e-69  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.572977  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1133  hypothetical protein  74.31 
 
 
144 aa  228  2e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000664449  normal  0.51318 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2481  hypothetical protein  72.92 
 
 
144 aa  227  4e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.330818  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1123  hypothetical protein  74.31 
 
 
144 aa  222  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000274951  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1228  hypothetical protein  71.53 
 
 
144 aa  221  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000394867  normal  0.28109 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1328  hypothetical protein  77.52 
 
 
144 aa  213  5e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00762058 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2685  hypothetical protein  67.63 
 
 
149 aa  208  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188412  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2864  hypothetical protein  70.9 
 
 
153 aa  205  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0248676  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0539  hypothetical protein  49.15 
 
 
143 aa  130  5e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.703361  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3666  hypothetical protein  46.43 
 
 
146 aa  130  6e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03582  hypothetical protein  47.58 
 
 
143 aa  127  4.0000000000000003e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3721  hypothetical protein  49.23 
 
 
134 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03301  hypothetical protein  43.97 
 
 
173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002452  hypothetical protein  44.35 
 
 
143 aa  123  7e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0009  hypothetical protein  45.24 
 
 
143 aa  123  1e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3044  hypothetical protein  44.6 
 
 
146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.766056  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5325  hypothetical protein  38.36 
 
 
144 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4157  hypothetical protein  33.06 
 
 
138 aa  87  7e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2922  hypothetical protein  31.65 
 
 
149 aa  86.7  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1677  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2425  hypothetical protein  30.71 
 
 
150 aa  84.3  5e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4972  hypothetical protein  35.07 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5099  hypothetical protein  35.07 
 
 
144 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.403368  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03020  hypothetical protein  34.43 
 
 
139 aa  81.6  0.000000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0366  hypothetical protein  35.07 
 
 
144 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5149  hypothetical protein  32.84 
 
 
144 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.627977 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0251  hypothetical protein  28.87 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0530  hypothetical protein  28.68 
 
 
150 aa  73.6  0.0000000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0487  hypothetical protein  31.69 
 
 
139 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05060  hypothetical protein  31.69 
 
 
139 aa  72  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3646  ribosomal protein L28  29.69 
 
 
146 aa  72.4  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>