38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4972 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_4972  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  291  2e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5099  hypothetical protein  95.83 
 
 		 144 aa  279  8.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.403368  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5149  hypothetical protein  93.75 
 
 		 144 aa  274  3e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.627977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0366  hypothetical protein  85.42 
 
 		 144 aa  256  1e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5325  hypothetical protein  57.64 
 
 		 144 aa  182  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0487  hypothetical protein  49.66 
 
 		 139 aa  149  1e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05060  hypothetical protein  48.97 
 
 		 139 aa  148  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4157  hypothetical protein  52.94 
 
 		 138 aa  141  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03020  hypothetical protein  48.33 
 
 		 139 aa  122  2e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3666  hypothetical protein  35.51 
 
 		 146 aa  94.7  4e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03301  hypothetical protein  34.25 
 
 		 173 aa  92.8  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0009  hypothetical protein  39.52 
 
 		 143 aa  93.2  1e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0539  hypothetical protein  43.59 
 
 		 143 aa  89.7  1e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.703361  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3721  hypothetical protein  38.52 
 
 		 134 aa  88.6  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03582  hypothetical protein  38.46 
 
 		 143 aa  86.3  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002452  hypothetical protein  38.46 
 
 		 143 aa  84  6e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1334  hypothetical protein  35.07 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000385452  hitchhiker  0.0000682946 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3187  hypothetical protein  35.07 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000444693  normal  0.170187 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3044  hypothetical protein  35.07 
 
 		 144 aa  82.8  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000942891  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3029  hypothetical protein  35.07 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00182183  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2691  hypothetical protein  35.07 
 
 		 144 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.572977  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3357  hypothetical protein  34.29 
 
 		 144 aa  81.3  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2922  hypothetical protein  30.95 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1677  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1260  hypothetical protein  33.09 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0719621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1189  hypothetical protein  33.09 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1190  hypothetical protein  33.09 
 
 		 144 aa  80.5  0.000000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.201657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0251  hypothetical protein  33.82 
 
 		 142 aa  80.1  0.000000000000009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1133  hypothetical protein  33.33 
 
 		 144 aa  78.2  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000664449  normal  0.51318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1123  hypothetical protein  32.37 
 
 		 144 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000274951  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2685  hypothetical protein  31.03 
 
 		 149 aa  77  0.00000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188412  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2481  hypothetical protein  34.68 
 
 		 144 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.330818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0530  hypothetical protein  30.77 
 
 		 150 aa  75.5  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2864  hypothetical protein  34.68 
 
 		 153 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0248676  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1328  hypothetical protein  32.23 
 
 		 144 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762058 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1228  hypothetical protein  29.79 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000394867  normal  0.28109 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3044  hypothetical protein  32.14 
 
 		 146 aa  70.5  0.000000000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.766056  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3646  ribosomal protein L28  31.75 
 
 		 146 aa  68.6  0.00000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2425  hypothetical protein  29.2 
 
 		 150 aa  64.7  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>