38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_1228 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_1228  hypothetical protein  100 
 
 		 144 aa  291  2e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000000394867  normal  0.28109 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1133  hypothetical protein  74.31 
 
 		 144 aa  233  8e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000664449  normal  0.51318 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1328  hypothetical protein  84.5 
 
 		 144 aa  232  1.0000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00762058 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1123  hypothetical protein  75.69 
 
 		 144 aa  231  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000274951  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3187  hypothetical protein  71.53 
 
 		 144 aa  221  2e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000444693  normal  0.170187 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3029  hypothetical protein  71.53 
 
 		 144 aa  221  2e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00182183  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1334  hypothetical protein  71.53 
 
 		 144 aa  221  2e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000385452  hitchhiker  0.0000682946 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3044  hypothetical protein  71.53 
 
 		 144 aa  221  2e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000942891  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3357  hypothetical protein  71.53 
 
 		 144 aa  221  2e-57  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2481  hypothetical protein  68.75 
 
 		 144 aa  217  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.330818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1189  hypothetical protein  69.44 
 
 		 144 aa  216  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.177556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1260  hypothetical protein  69.44 
 
 		 144 aa  216  7.999999999999999e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0719621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1190  hypothetical protein  69.44 
 
 		 144 aa  216  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.201657  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2685  hypothetical protein  65.96 
 
 		 149 aa  209  7.999999999999999e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000188412  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2691  hypothetical protein  64.58 
 
 		 144 aa  209  1e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.572977  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2864  hypothetical protein  67.16 
 
 		 153 aa  202  2e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0248676  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3666  hypothetical protein  47.86 
 
 		 146 aa  133  6.0000000000000005e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0539  hypothetical protein  50.42 
 
 		 143 aa  129  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.703361  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03582  hypothetical protein  49.19 
 
 		 143 aa  126  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002452  hypothetical protein  47.58 
 
 		 143 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3721  hypothetical protein  46.72 
 
 		 134 aa  124  6e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0009  hypothetical protein  42.86 
 
 		 143 aa  115  3e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3044  hypothetical protein  43.36 
 
 		 146 aa  110  8.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.766056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03301  hypothetical protein  41.13 
 
 		 173 aa  107  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2922  hypothetical protein  34.31 
 
 		 149 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.1677  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5325  hypothetical protein  37.67 
 
 		 144 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.417137 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03020  hypothetical protein  38.89 
 
 		 139 aa  85.1  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4157  hypothetical protein  35.54 
 
 		 138 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0487  hypothetical protein  34.31 
 
 		 139 aa  84  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05060  hypothetical protein  32.85 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2425  hypothetical protein  30 
 
 		 150 aa  83.6  9e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3646  ribosomal protein L28  33.08 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0251  hypothetical protein  32.37 
 
 		 142 aa  79  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.774201 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4972  hypothetical protein  29.79 
 
 		 144 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5099  hypothetical protein  29.08 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.403368  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0530  hypothetical protein  28.24 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5149  hypothetical protein  29.08 
 
 		 144 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.627977 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0366  hypothetical protein  29.79 
 
 		 144 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>