19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_23850 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_23850  hypothetical protein  100 
 
 
460 aa  902    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0149528  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2307  hypothetical protein  37.6 
 
 
644 aa  181  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000320595  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0626  hypothetical protein  33.07 
 
 
504 aa  179  9e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0376  hypothetical protein  39.02 
 
 
742 aa  163  5.0000000000000005e-39  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0294  hypothetical protein  40.87 
 
 
654 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03560  hypothetical protein  37.55 
 
 
676 aa  147  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0660497  normal  0.0241911 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3227  hypothetical protein  34.59 
 
 
534 aa  140  6e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2253  hypothetical protein  29.43 
 
 
617 aa  117  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3210  hypothetical protein  34.66 
 
 
592 aa  112  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.575907  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1903  hypothetical protein  32.24 
 
 
628 aa  109  9.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30080  hypothetical protein  31.66 
 
 
616 aa  106  7e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.798837  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1136  hypothetical protein  29.97 
 
 
598 aa  103  6e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0147757  hitchhiker  0.000102778 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2159  hypothetical protein  31.86 
 
 
286 aa  98.6  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.899979  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0131  hypothetical protein  26.76 
 
 
644 aa  95.9  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.153652  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1135  hypothetical protein  29.31 
 
 
579 aa  94.7  3e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00673541  hitchhiker  0.000103654 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1286  hypothetical protein  28.57 
 
 
762 aa  76.6  0.0000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.275531  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0094  hypothetical protein  31.48 
 
 
371 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3118  hypothetical protein  34.93 
 
 
594 aa  59.3  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.092965  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  27.18 
 
 
537 aa  51.2  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>