20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1286 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008531  LEUM_1286  hypothetical protein  100 
 
 
762 aa  1439    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.275531  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3118  hypothetical protein  40.19 
 
 
594 aa  115  4.0000000000000004e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.092965  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0094  hypothetical protein  34.15 
 
 
371 aa  110  8.000000000000001e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2253  hypothetical protein  32.47 
 
 
617 aa  99.8  2e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1135  hypothetical protein  34.67 
 
 
579 aa  95.1  4e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00673541  hitchhiker  0.000103654 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2307  hypothetical protein  32.8 
 
 
644 aa  93.6  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000320595  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0626  hypothetical protein  33.33 
 
 
504 aa  85.5  0.000000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0294  hypothetical protein  38.79 
 
 
654 aa  85.5  0.000000000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30080  hypothetical protein  30.99 
 
 
616 aa  85.1  0.000000000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.798837  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0376  hypothetical protein  32.46 
 
 
742 aa  85.5  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3227  hypothetical protein  35.45 
 
 
534 aa  84.7  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1136  hypothetical protein  32.03 
 
 
598 aa  82.8  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0147757  hitchhiker  0.000102778 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23850  hypothetical protein  28.81 
 
 
460 aa  80.5  0.0000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0149528  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0131  hypothetical protein  29.04 
 
 
644 aa  80.1  0.0000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.153652  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03560  hypothetical protein  31.94 
 
 
676 aa  76.6  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0660497  normal  0.0241911 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  29.95 
 
 
537 aa  74.7  0.000000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1903  hypothetical protein  26.82 
 
 
628 aa  73.9  0.00000000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2159  hypothetical protein  29.03 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.899979  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3210  hypothetical protein  34.67 
 
 
592 aa  66.2  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.575907  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4019  Acyl transferase  26.42 
 
 
5526 aa  46.2  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>