19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2159 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009012  Cthe_2159  hypothetical protein  100 
 
 
286 aa  562  1.0000000000000001e-159  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.899979  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03560  hypothetical protein  44.5 
 
 
676 aa  161  1e-38  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0660497  normal  0.0241911 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1136  hypothetical protein  37.68 
 
 
598 aa  155  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0147757  hitchhiker  0.000102778 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2253  hypothetical protein  41.18 
 
 
617 aa  155  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3118  hypothetical protein  37.98 
 
 
594 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.092965  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1135  hypothetical protein  35.75 
 
 
579 aa  149  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00673541  hitchhiker  0.000103654 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0376  hypothetical protein  37.62 
 
 
742 aa  140  1.9999999999999998e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3210  hypothetical protein  36.87 
 
 
592 aa  140  3e-32  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.575907  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3227  hypothetical protein  36.18 
 
 
534 aa  139  7.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0294  hypothetical protein  36.96 
 
 
654 aa  138  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30080  hypothetical protein  33.04 
 
 
616 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.798837  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2307  hypothetical protein  33.81 
 
 
644 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000320595  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0626  hypothetical protein  37.5 
 
 
504 aa  129  5.0000000000000004e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0131  hypothetical protein  36.32 
 
 
644 aa  122  9e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.153652  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1903  hypothetical protein  31.88 
 
 
628 aa  114  2.0000000000000002e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  35.29 
 
 
537 aa  112  8.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23850  hypothetical protein  33.16 
 
 
460 aa  99  8e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0149528  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0094  hypothetical protein  35.32 
 
 
371 aa  77.8  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1286  hypothetical protein  29.03 
 
 
762 aa  71.2  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.275531  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>