19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3210 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013530  Xcel_3210  hypothetical protein  100 
 
 
592 aa  1102    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.575907  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3118  hypothetical protein  48.82 
 
 
594 aa  320  7e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.092965  normal  0.169209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2253  hypothetical protein  39.63 
 
 
617 aa  310  5.9999999999999995e-83  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1136  hypothetical protein  40.43 
 
 
598 aa  287  2.9999999999999996e-76  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0147757  hitchhiker  0.000102778 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1903  hypothetical protein  37.85 
 
 
628 aa  281  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1135  hypothetical protein  36.64 
 
 
579 aa  249  1e-64  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00673541  hitchhiker  0.000103654 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0376  hypothetical protein  35.19 
 
 
742 aa  238  3e-61  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3227  hypothetical protein  49.65 
 
 
534 aa  214  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0626  hypothetical protein  30.12 
 
 
504 aa  193  9e-48  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0160352  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0131  hypothetical protein  26.29 
 
 
644 aa  154  4e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.153652  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2159  hypothetical protein  36.87 
 
 
286 aa  140  7.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.899979  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2307  hypothetical protein  33.45 
 
 
644 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000320595  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0294  hypothetical protein  35.69 
 
 
654 aa  134  6e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0729  cellulosome enzyme, dockerin type I  32.57 
 
 
537 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23850  hypothetical protein  34.66 
 
 
460 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0149528  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30080  hypothetical protein  49.22 
 
 
616 aa  102  2e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.798837  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0094  hypothetical protein  40.65 
 
 
371 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1286  hypothetical protein  25.36 
 
 
762 aa  69.3  0.0000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.275531  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03560  hypothetical protein  31.25 
 
 
676 aa  68.6  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0660497  normal  0.0241911 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>