80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2219 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2219  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like  100 
 
 		 445 aa  927    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.507112 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0923  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic component-like protein  30.28 
 
 		 381 aa  116  8.999999999999998e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0258844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2084  ABC transporter substrate-binding protein  26.1 
 
 		 484 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.80637  normal  0.146127 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1474  ABC transporter substrate-binding protein  26.79 
 
 		 473 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0903726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6153  ABC transporter substrate-binding protein  25.31 
 
 		 490 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.405188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0674  ABC transporter sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  24.78 
 
 		 474 aa  77.8  0.0000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.288479  normal  0.376687 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4200  ABC transporter substrate-binding protein  29.61 
 
 		 475 aa  73.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1974  nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein, putative  26.25 
 
 		 474 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.507629  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6103  nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein, putative  26.25 
 
 		 474 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.762098  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1998  nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein, putative  26.25 
 
 		 474 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.420561  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1296  nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein, putative  24.76 
 
 		 474 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.232575  normal  0.301895 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4880  putative ABC transporter, substrate-binding protein  22.81 
 
 		 481 aa  68.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0732129 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3161  nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein, putative  24.53 
 
 		 467 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.230597  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0207  nitrate ABC transporter, periplasmic nitrate-binding protein, putative  24.36 
 
 		 468 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.497934 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5011  putative sulfonate transport system substrate-binding protein  23.48 
 
 		 468 aa  64.3  0.000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4186  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.68 
 
 		 480 aa  60.8  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.917027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3672  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.19 
 
 		 480 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0748174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3347  putative ABC transporter, substrate-binding protein  23.19 
 
 		 480 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.636052  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2622  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  21.56 
 
 		 341 aa  57  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000404129  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0122  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.76 
 
 		 345 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.592711  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0723  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.76 
 
 		 345 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5414  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25.86 
 
 		 326 aa  52  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.445951  hitchhiker  0.00207004 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3788  ABC transporter, substrate-binding component  20.64 
 
 		 473 aa  51.2  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19540  hypothetical protein  24.35 
 
 		 323 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5316  sulfonate ABC transporter, periplasmic sulfonate-binding protein, putative  26.41 
 
 		 321 aa  50.4  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0114  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.57 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104516 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0105  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.57 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.28017  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1682  hypothetical protein  24.35 
 
 		 323 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4876  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.41 
 
 		 321 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0095  substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  25.57 
 
 		 341 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.106306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1147  hypothetical protein  19.57 
 
 		 345 aa  49.7  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.966903  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4323  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.33 
 
 		 326 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.174195 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1211  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  26.43 
 
 		 321 aa  47  0.0006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2507  ABC transporter substrate-binding protein  24.89 
 
 		 334 aa  47  0.0006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.553979  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1372  Substrate-binding region of ABC-type glycine betaine transport system  21.72 
 
 		 351 aa  47  0.0008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4570  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.71 
 
 		 329 aa  46.2  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.285376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0389  taurine transporter substrate binding subunit  25.13 
 
 		 320 aa  46.6  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1098  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  28.93 
 
 		 319 aa  46.2  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0897398  normal  0.248761 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1322  glycine betaine ABC transporter substrate-binding protein  24.51 
 
 		 351 aa  46.6  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.151966 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0113  sulfonate binding protein  25.64 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00282136 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1504  extracellular solute-binding protein  25.56 
 
 		 349 aa  45.4  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.190245  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3482  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.38 
 
 		 340 aa  45.4  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4975  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  27.18 
 
 		 321 aa  45.8  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000230006  hitchhiker  0.00807974 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2960  sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein, putative  19.4 
 
 		 328 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.641077  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5064  ABC-type nitrate/sulfonate/bicarbonate transport systems periplasmic components-like protein  26.59 
 
 		 336 aa  44.7  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.133964  normal  0.134479 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1370  ABC transporter substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  20.77 
 
 		 345 aa  44.7  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.759822  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2660  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  28.43 
 
 		 319 aa  45.1  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.536053  normal  0.0112507 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0237  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.4 
 
 		 321 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00268504 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0261  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.4 
 
 		 321 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.766816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00947  hypothetical protein  28.43 
 
 		 319 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.525571  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1051  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  28.43 
 
 		 316 aa  44.7  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.588314  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0252  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  28.4 
 
 		 321 aa  45.1  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0269114  normal  0.27021 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00940  alkanesulfonate transporter subunit  28.43 
 
 		 319 aa  45.1  0.003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.597544  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4566  taurine transporter substrate binding subunit  24.46 
 
 		 331 aa  44.3  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4061  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.29 
 
 		 318 aa  44.7  0.004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1977  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  25 
 
 		 351 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.764481  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2438  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  21.51 
 
 		 322 aa  44.3  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0278  taurine transporter substrate binding subunit  24.43 
 
 		 320 aa  44.3  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3242  taurine ABC transporter, periplasmic binding protein  24.6 
 
 		 320 aa  43.9  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00319  hypothetical protein  24.6 
 
 		 320 aa  44.3  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3606  ABC transporter, substrate-binding protein, aliphatic sulphonates  26.43 
 
 		 323 aa  43.9  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.331945 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0440  taurine transporter substrate binding subunit  24.6 
 
 		 320 aa  43.9  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00315  taurine transporter subunit  24.6 
 
 		 320 aa  44.3  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0428  taurine transporter substrate binding subunit  24.6 
 
 		 320 aa  43.9  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1045  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  28.43 
 
 		 333 aa  44.3  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0394  taurine transporter substrate binding subunit  24.6 
 
 		 320 aa  44.3  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.560594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3263  taurine transporter substrate binding subunit  24.6 
 
 		 320 aa  44.3  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0838  taurine transporter substrate binding subunit  24.86 
 
 		 320 aa  43.9  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.467754 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3405  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  22.4 
 
 		 327 aa  44.3  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.215064  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2382  alkanesulfonate transporter substrate-binding subunit  26.9 
 
 		 333 aa  44.3  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3938  taurine transporter substrate binding subunit  24.6 
 
 		 347 aa  43.9  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2920  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  19.03 
 
 		 328 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10374e-18 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2663  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  24.62 
 
 		 326 aa  43.5  0.007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0258  taurine transporter substrate binding subunit  24.6 
 
 		 353 aa  43.5  0.007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2707  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplasmic ligand-binding protein  27.92 
 
 		 319 aa  43.5  0.008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.860316  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6160  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  24.39 
 
 		 343 aa  43.5  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.419436 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2312  putative sulfonate ABC transporter, sulfonate-binding protein  18.66 
 
 		 328 aa  43.5  0.009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.355114  hitchhiker  0.0000000431055 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3542  NLPA lipoprotein  23.28 
 
 		 313 aa  43.1  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1213  aliphatic sulfonates family ABC transporter, periplsmic ligand-binding protein  27.68 
 
 		 330 aa  43.1  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.63943  normal  0.0779306 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2420  aliphatic sulfonate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  25.15 
 
 		 340 aa  43.1  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311787  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>