15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3009 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_3009  hypothetical protein  100 
 
 		 190 aa  393  1e-109  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0375  hypothetical protein  50 
 
 		 189 aa  185  3e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3920  hypothetical protein  37.78 
 
 		 190 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000593759  hitchhiker  0.00522191 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0683  hypothetical protein  36.05 
 
 		 190 aa  135  5e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2454  hypothetical protein  32.57 
 
 		 188 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.185754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1036  hypothetical protein  32.79 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3616  hypothetical protein  30 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199395 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1072  hypothetical protein  29.89 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.788856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5259  hypothetical protein  33.08 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542652  hitchhiker  0.000548538 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0676  hypothetical protein  27.45 
 
 		 209 aa  69.7  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3148  hypothetical protein  29.03 
 
 		 200 aa  57  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613435  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1688  hypothetical protein  25.71 
 
 		 210 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2544  hypothetical protein  27.34 
 
 		 155 aa  49.3  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1650  hypothetical protein  35.19 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1702  protein of unknown function DUF399  28.89 
 
 		 411 aa  42  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0381555  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>