12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_1650 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_1650  hypothetical protein  100 
 
 		 192 aa  388  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2831  hypothetical protein  74.48 
 
 		 192 aa  296  1e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0828  hypothetical protein  48.74 
 
 		 439 aa  175  3e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.734723  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1501  hypothetical protein  43 
 
 		 437 aa  150  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0860  hypothetical protein  37.5 
 
 		 427 aa  101  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1739  hypothetical protein  33.33 
 
 		 409 aa  94  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3814  hypothetical protein  34 
 
 		 423 aa  85.5  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3034  hypothetical protein  28.57 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100979 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1962  hypothetical protein  28.57 
 
 		 199 aa  44.7  0.0008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134742  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3009  hypothetical protein  35.19 
 
 		 190 aa  42.7  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0375  hypothetical protein  35.85 
 
 		 189 aa  42.4  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1820  hypothetical protein  27 
 
 		 409 aa  41.2  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448323  normal  0.25103 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>