13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_3814 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011729  PCC7424_3814  hypothetical protein  100 
 
 
423 aa  840    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1501  hypothetical protein  38.12 
 
 
437 aa  216  5e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1820  hypothetical protein  27.45 
 
 
409 aa  136  9e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448323  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1739  hypothetical protein  30.33 
 
 
409 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0828  hypothetical protein  29.45 
 
 
439 aa  130  6e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.734723  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2831  hypothetical protein  33 
 
 
192 aa  78.2  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0860  hypothetical protein  30.57 
 
 
427 aa  71.6  0.00000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1650  hypothetical protein  34 
 
 
192 aa  70.1  0.00000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0973  hypothetical protein  27.75 
 
 
198 aa  68.9  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3034  hypothetical protein  26.94 
 
 
199 aa  49.7  0.00009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100979 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1962  hypothetical protein  26.51 
 
 
199 aa  47.8  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.134742  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1132  hypothetical protein  29.85 
 
 
344 aa  46.6  0.0009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4340  hypothetical protein  26.24 
 
 
201 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142326  normal  0.0705595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>