14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0828 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0828  hypothetical protein  100 
 
 		 439 aa  859    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.734723  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1501  hypothetical protein  53.27 
 
 		 437 aa  211  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0860  hypothetical protein  35.1 
 
 		 427 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1739  hypothetical protein  31.32 
 
 		 409 aa  177  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2831  hypothetical protein  49.75 
 
 		 192 aa  168  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1650  hypothetical protein  48.74 
 
 		 192 aa  155  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3814  hypothetical protein  29.45 
 
 		 423 aa  130  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0973  hypothetical protein  34.55 
 
 		 198 aa  70.5  0.00000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1820  hypothetical protein  30.43 
 
 		 409 aa  68.9  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448323  normal  0.25103 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3034  hypothetical protein  29.63 
 
 		 199 aa  59.7  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00100979 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1132  hypothetical protein  28.86 
 
 		 344 aa  53.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4340  hypothetical protein  27.98 
 
 		 201 aa  49.3  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.142326  normal  0.0705595 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5259  hypothetical protein  25.25 
 
 		 204 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542652  hitchhiker  0.000548538 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1823  hypothetical protein  22.96 
 
 		 426 aa  43.9  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>