13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1688 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1688  hypothetical protein  100 
 
 		 210 aa  429  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2544  hypothetical protein  97.42 
 
 		 155 aa  312  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0676  hypothetical protein  48.54 
 
 		 209 aa  176  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5259  hypothetical protein  36.36 
 
 		 204 aa  108  5e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542652  hitchhiker  0.000548538 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3148  hypothetical protein  36.6 
 
 		 200 aa  102  4e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613435  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3920  hypothetical protein  29.9 
 
 		 190 aa  85.1  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000593759  hitchhiker  0.00522191 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2543  hypothetical protein  91.18 
 
 		 43 aa  64.7  0.0000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2454  hypothetical protein  28.8 
 
 		 188 aa  61.2  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.185754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0375  hypothetical protein  29.73 
 
 		 189 aa  58.2  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3616  hypothetical protein  26.39 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199395 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3009  hypothetical protein  25.71 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1072  hypothetical protein  24.63 
 
 		 193 aa  49.3  0.00005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.788856 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1036  hypothetical protein  26.09 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197931  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>