13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2454 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2454  hypothetical protein  100 
 
 		 188 aa  377  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.185754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0375  hypothetical protein  33.51 
 
 		 189 aa  116  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3009  hypothetical protein  32.57 
 
 		 190 aa  108  3e-23  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1036  hypothetical protein  32.95 
 
 		 189 aa  105  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3920  hypothetical protein  33.71 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000593759  hitchhiker  0.00522191 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0683  hypothetical protein  31.58 
 
 		 190 aa  89  4e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5259  hypothetical protein  33.93 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542652  hitchhiker  0.000548538 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1072  hypothetical protein  30.51 
 
 		 193 aa  82.4  0.000000000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.788856 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3616  hypothetical protein  28.65 
 
 		 190 aa  65.5  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199395 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1688  hypothetical protein  28.8 
 
 		 210 aa  61.2  0.000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3148  hypothetical protein  30.28 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613435  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0676  hypothetical protein  31.22 
 
 		 209 aa  53.9  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2544  hypothetical protein  29.41 
 
 		 155 aa  47.4  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>