13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1036 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1036  hypothetical protein  100 
 
 		 189 aa  388  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0197931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3616  hypothetical protein  45.16 
 
 		 190 aa  159  2e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199395 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0375  hypothetical protein  36.26 
 
 		 189 aa  106  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2454  hypothetical protein  32.95 
 
 		 188 aa  105  3e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.185754  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3009  hypothetical protein  32.79 
 
 		 190 aa  105  4e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3920  hypothetical protein  30.98 
 
 		 190 aa  104  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000000593759  hitchhiker  0.00522191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5259  hypothetical protein  31.58 
 
 		 204 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.542652  hitchhiker  0.000548538 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0683  hypothetical protein  31.18 
 
 		 190 aa  87  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3148  hypothetical protein  32.04 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.613435  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0676  hypothetical protein  27.72 
 
 		 209 aa  78.2  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1072  hypothetical protein  27.84 
 
 		 193 aa  72.8  0.000000000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.788856 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1688  hypothetical protein  26.09 
 
 		 210 aa  44.7  0.0009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2544  hypothetical protein  25.96 
 
 		 155 aa  42.7  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>