24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1046 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007298  Daro_3605  hypothetical protein  47.64 
 
 		 863 aa  796    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000881284 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1046  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  100 
 
 		 895 aa  1857    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3159  hypothetical protein  34.65 
 
 		 900 aa  561  1e-158  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0980935  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0666  hypothetical protein  35.87 
 
 		 1193 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1083  hypothetical protein  29.42 
 
 		 831 aa  338  2.9999999999999997e-91  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5245  hypothetical protein  33.46 
 
 		 2204 aa  256  2.0000000000000002e-66  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.291359  hitchhiker  0.0000299325 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0364  hypothetical protein  26.26 
 
 		 821 aa  256  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2554  hypothetical protein  33.11 
 
 		 1131 aa  218  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1677  hypothetical protein  32.89 
 
 		 1131 aa  212  3e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0671  hypothetical protein  24.64 
 
 		 831 aa  192  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3932  hypothetical protein  24.77 
 
 		 921 aa  192  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0926169 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2998  hypothetical protein  22.85 
 
 		 906 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2457  hypothetical protein  26.05 
 
 		 866 aa  164  1e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0520379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5244  hypothetical protein  29.14 
 
 		 175 aa  68.9  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000191659  hitchhiker  0.000000566819 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1153  hypothetical protein  32.99 
 
 		 110 aa  47.8  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.777274  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01977  hypothetical protein  32.99 
 
 		 110 aa  47.8  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01985  hypothetical protein  32.99 
 
 		 110 aa  47.8  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0980  hypothetical protein  32.99 
 
 		 110 aa  47.8  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.920473  normal  0.600438 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1561  hypothetical protein  32.99 
 
 		 110 aa  47.8  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.559932  normal  0.425053 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2372  hypothetical protein  32.99 
 
 		 110 aa  47.8  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2222  hypothetical protein  32.99 
 
 		 110 aa  47.8  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3020  hypothetical protein  32.99 
 
 		 110 aa  47  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0509462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2948  hypothetical protein  38.6 
 
 		 650 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1576  protein of unknown function DUF1508  31.96 
 
 		 110 aa  46.2  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.667932  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>