13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2554 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_2554  hypothetical protein  100 
 
 		 1131 aa  2310    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1677  hypothetical protein  92.13 
 
 		 1131 aa  2082    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0666  hypothetical protein  39.15 
 
 		 1193 aa  492  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.447807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1046  response regulator receiver /GGDEF/PAS/PAC domain-containing protein  33.11 
 
 		 895 aa  221  8.999999999999998e-56  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3159  hypothetical protein  30.02 
 
 		 900 aa  204  7e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0980935  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3605  hypothetical protein  34.1 
 
 		 863 aa  202  3.9999999999999996e-50  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000881284 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5245  hypothetical protein  33.55 
 
 		 2204 aa  164  7e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.291359  hitchhiker  0.0000299325 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1083  hypothetical protein  28.63 
 
 		 831 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0364  hypothetical protein  28.51 
 
 		 821 aa  122  3e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3932  hypothetical protein  27.84 
 
 		 921 aa  117  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0926169 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2998  hypothetical protein  23.28 
 
 		 906 aa  99.4  3e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2457  hypothetical protein  29.07 
 
 		 866 aa  92.4  4e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0520379  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0671  hypothetical protein  24.83 
 
 		 831 aa  84  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>