25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4924 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_3618  conserved hypothetical protein  99.17 
 
 		 1551 bp  2315    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04222  hypothetical protein  99.17 
 
 		 1551 bp  2315    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177714  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5894    98.63 
 
 		 1269 bp  1901    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4924    100 
 
 		 1236 bp  2450    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4928  hypothetical protein  97.52 
 
 		 1551 bp  2157    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3676  hypothetical protein  99.09 
 
 		 1551 bp  2307    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063204 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4978  hypothetical protein  99.25 
 
 		 1551 bp  2323    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04256  hypothetical protein  99.17 
 
 		 1551 bp  2315    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137838  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4615  hypothetical protein  99.17 
 
 		 1551 bp  2315    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4820  hypothetical protein  80.81 
 
 		 1551 bp  555  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4974  hypothetical protein  80.56 
 
 		 1551 bp  531  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.164186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4981  hypothetical protein  80.48 
 
 		 1551 bp  523  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.986087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4888  hypothetical protein  80.48 
 
 		 1551 bp  523  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00183026  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0540  hypothetical protein  81.18 
 
 		 1548 bp  365  2e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00218193  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4922  hypothetical protein  80.79 
 
 		 1551 bp  337  5e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.573575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5893    100 
 
 		 246 bp  303  6e-80  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.803588  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2283  hypothetical protein  91.67 
 
 		 1563 bp  63.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.02604  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2062  hypothetical protein  91.67 
 
 		 1563 bp  63.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000491691 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2066  hypothetical protein  94.12 
 
 		 1551 bp  52  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2735  D-serine dehydratase  100 
 
 		 1269 bp  52  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2273    100 
 
 		 652 bp  52  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1688    100 
 
 		 2452 bp  52  0.0004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00110161  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0268  hypothetical protein  92.11 
 
 		 1554 bp  52  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00938119 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2407  hypothetical protein  88.89 
 
 		 1560 bp  50.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02540  hypothetical protein  93.75 
 
 		 1545 bp  48.1  0.006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>