32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E1688 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01478  tagaturonate reductase  98.55 
 
 		 1452 bp  1800    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2125  Mannitol dehydrogenase domain protein  98.44 
 
 		 1452 bp  1792    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.048093  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01489  hypothetical protein  98.55 
 
 		 1452 bp  1800    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2134  altronate oxidoreductase  97.3 
 
 		 1452 bp  1705    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.153738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1603  altronate oxidoreductase  98.76 
 
 		 1452 bp  1816    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1721  altronate oxidoreductase  98.03 
 
 		 1452 bp  1760    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0141374  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1688    100 
 
 		 2452 bp  4861    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00110161  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2137  altronate oxidoreductase  98.65 
 
 		 1452 bp  1808    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1651  altronate oxidoreductase  96.89 
 
 		 1452 bp  1673    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0488897  normal  0.828836 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1685  altronate oxidoreductase  100 
 
 		 243 bp  482  1e-133  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00119512  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2013  altronate oxidoreductase  80.93 
 
 		 1452 bp  274  1e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0988522  normal  0.0895016 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2270  hypothetical protein  97.67 
 
 		 132 bp  224  8.999999999999998e-56  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0212151  normal  0.825318 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1606  IS66 family element, transposase  100 
 
 		 1317 bp  147  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000125107  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0747  altronate oxidoreductase  84.75 
 
 		 1467 bp  137  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.400911  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2273    100 
 
 		 652 bp  123  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0555  altronate oxidoreductase  90.36 
 
 		 1452 bp  101  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1103    90.36 
 
 		 1451 bp  101  9e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.145219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0492  altronate oxidoreductase  90.36 
 
 		 1452 bp  101  9e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.504858  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0064  altronate oxidoreductase  88.31 
 
 		 1446 bp  81.8  0.0000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0530  altronate oxidoreductase  80.54 
 
 		 1467 bp  81.8  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0058  altronate oxidoreductase  88.31 
 
 		 1446 bp  81.8  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03523  TrbC-like protein  92.86 
 
 		 1164 bp  79.8  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.236251  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3510  altronate oxidoreductase  82.58 
 
 		 1452 bp  79.8  0.000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3384  altronate oxidoreductase  85.56 
 
 		 1452 bp  75.8  0.00000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1242  hypothetical protein  100 
 
 		 594 bp  69.9  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.568713  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1857    97.37 
 
 		 2422 bp  67.9  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1638  hypothetical protein  100 
 
 		 114 bp  67.9  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0252  lysozyme  100 
 
 		 291 bp  67.9  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1562  hypothetical protein  100 
 
 		 477 bp  67.9  0.00000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1414  hypothetical protein  89.29 
 
 		 312 bp  63.9  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.365859  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4924    100 
 
 		 1236 bp  52  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2735  D-serine dehydratase  100 
 
 		 1269 bp  52  0.0008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>