28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E2273 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_2075  hypothetical protein  97.96 
 
 		 1053 bp  1070    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.602347  normal  0.562441 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1434  hypothetical protein  98.65 
 
 		 1053 bp  1110    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.782992  normal  0.247689 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01059  hypothetical protein  99.49 
 
 		 1053 bp  1150    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2273    100 
 
 		 652 bp  1292    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2545  hypothetical protein  99.83 
 
 		 1053 bp  1166    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.320065  normal  0.508953 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1177  hypothetical protein  99.32 
 
 		 1053 bp  1142    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1178  hypothetical protein  99.83 
 
 		 1053 bp  1166    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.762117  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01051  hypothetical protein  99.49 
 
 		 1053 bp  1150    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2591  Rhodanese domain protein  99.66 
 
 		 1053 bp  1158    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.894148  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2033  hypothetical protein  85.1 
 
 		 1053 bp  333  4e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1267  hypothetical protein  84.86 
 
 		 1053 bp  325  9.000000000000001e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2217  hypothetical protein  84.62 
 
 		 1053 bp  317  1.9999999999999998e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.598434 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1252  hypothetical protein  84.13 
 
 		 1053 bp  301  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.987741 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1223  hypothetical protein  84.13 
 
 		 1053 bp  301  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.468871 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1569  hypothetical protein  80.8 
 
 		 1050 bp  266  6.999999999999999e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.626506 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1688    100 
 
 		 2452 bp  123  7e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00110161  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1886  hypothetical protein  78.21 
 
 		 1071 bp  105  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.442836  hitchhiker  0.000682 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1710  hypothetical protein  81.17 
 
 		 1020 bp  75.8  0.00000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.351955  hitchhiker  0.000231856 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1668  hypothetical protein  81.17 
 
 		 1068 bp  75.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1560  hypothetical protein  81.17 
 
 		 1068 bp  75.8  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.517054  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2519  hypothetical protein  80.82 
 
 		 1068 bp  67.9  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2824  hypothetical protein  90.57 
 
 		 1068 bp  65.9  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.912445  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1608  Rhodanese domain protein  79.64 
 
 		 1062 bp  61.9  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2735  D-serine dehydratase  100 
 
 		 1269 bp  54  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3823  hypothetical protein  89.13 
 
 		 945 bp  52  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.455102  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4924    100 
 
 		 1236 bp  52  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1574  Rhodanese domain protein  85.25 
 
 		 1059 bp  50.1  0.0008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3956  hypothetical protein  91.89 
 
 		 933 bp  50.1  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.765325  normal  0.0181852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>