30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_5893 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011353  ECH74115_5893    100 
 
 		 246 bp  488  1e-136  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.803588  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04256  hypothetical protein  100 
 
 		 1551 bp  486  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.137838  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04222  hypothetical protein  100 
 
 		 1551 bp  486  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.177714  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3676  hypothetical protein  100 
 
 		 1551 bp  486  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0063204 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4615  hypothetical protein  100 
 
 		 1551 bp  486  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3618  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 1551 bp  486  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4978  hypothetical protein  99.18 
 
 		 1551 bp  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4928  hypothetical protein  99.18 
 
 		 1551 bp  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4924    100 
 
 		 1236 bp  303  1e-80  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4888  hypothetical protein  86.12 
 
 		 1551 bp  216  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00183026  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4820  hypothetical protein  86.12 
 
 		 1551 bp  216  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4974  hypothetical protein  85.71 
 
 		 1551 bp  208  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.164186  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4922  hypothetical protein  85.71 
 
 		 1551 bp  208  5e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.573575  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0540  hypothetical protein  85.9 
 
 		 1548 bp  202  3e-50  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00218193  normal  0.0510318 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4981  hypothetical protein  85.31 
 
 		 1551 bp  200  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.986087  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04255  predicted pyruvate formate lyase activating enzyme  100 
 
 		 864 bp  58  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.542782  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04221  hypothetical protein  100 
 
 		 864 bp  58  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.606707  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5892  radical SAM domain protein  100 
 
 		 864 bp  58  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4923  radical SAM domain protein  100 
 
 		 864 bp  58  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4927  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 864 bp  58  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3677  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 864 bp  58  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.005025 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3619  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 864 bp  58  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4977  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 864 bp  58  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.258865  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4614  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 864 bp  58  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4973  pyruvate formate lyase activating enzyme  96.55 
 
 		 864 bp  50.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.577557  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4921  pyruvate formate lyase activating enzyme  96.55 
 
 		 864 bp  50.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4819  pyruvate formate lyase activating enzyme  96.55 
 
 		 864 bp  50.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.387597  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4886  pyruvate formate lyase activating enzyme  96.55 
 
 		 864 bp  50.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0614153  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4980  pyruvate formate lyase activating enzyme  96.55 
 
 		 864 bp  50.1  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.902486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0539  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 861 bp  46.1  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.536382  normal  0.0504206 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>