34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1889 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009632  SaurJH1_1923  ABC transporter EcsB  100 
 
 
407 aa  819    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0127322  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1889  ABC transporter EcsB  100 
 
 
407 aa  819    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.133724  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1371  ABC transporter, permease protein  61.43 
 
 
407 aa  521  1e-147  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0426454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1463  ABC transporter EcsB  25.43 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1085  ABC transporter, permease protein EscB  26.32 
 
 
403 aa  129  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0969  ABC transporter, permease  25.56 
 
 
403 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1214  ABC transporter, permease protein EscB  25.56 
 
 
403 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0964  ABC transporter EcsB  26.32 
 
 
403 aa  125  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1153  ABC transporter, permease protein EscB  24.81 
 
 
403 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4219  ABC transporter, permease protein EscB  25.13 
 
 
403 aa  125  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.0623448 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1126  ABC transporter, permease protein EscB  25.31 
 
 
403 aa  123  5e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0980  ABC transporter permease EscB  25.06 
 
 
403 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0959  ABC transporter, permease  24.56 
 
 
403 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1049  ABC transporter permease  25.06 
 
 
403 aa  122  9.999999999999999e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0816  ABC transporter EcsB  26.18 
 
 
403 aa  114  3e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494679  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0646  ABC transporter EcsB  25.87 
 
 
404 aa  101  2e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4437  putative permease  25.33 
 
 
399 aa  99  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0761847 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1028  putative permease  24.93 
 
 
399 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0936  permease, putative  24.93 
 
 
399 aa  97.8  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0900  putative permease  24.54 
 
 
399 aa  95.9  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.864791  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1261  ABC transporter EcsB  21.92 
 
 
400 aa  95.1  2e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000013948  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0748  hypothetical protein  24.54 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0940  putative permease  24.54 
 
 
399 aa  95.1  2e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000325724 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0753  hypothetical protein  24.54 
 
 
399 aa  94.4  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0844  permease  24.54 
 
 
399 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0804  permease  24.54 
 
 
399 aa  94  4e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2277  ABC transporter permease  23.33 
 
 
339 aa  91.7  2e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0754  ABC transporter EcsB  23.86 
 
 
399 aa  87.8  3e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0682  ABC transporter EcsB  23.41 
 
 
404 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1571  ABC transporter permease  23.68 
 
 
345 aa  79  0.0000000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0374  ABC transporter, permease protein  22.97 
 
 
344 aa  72  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1442  ABC transporter permease  22.11 
 
 
403 aa  70.9  0.00000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000890644  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1226  ABC transporter permease  21.36 
 
 
428 aa  58.9  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1635  ABC-2 type transport system permease protein  22.65 
 
 
399 aa  43.5  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00107608  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>