34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0374 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0374  ABC transporter, permease protein  100 
 
 
344 aa  680    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1571  ABC transporter permease  48.54 
 
 
345 aa  298  1e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2277  ABC transporter permease  40.58 
 
 
339 aa  216  2.9999999999999998e-55  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1261  ABC transporter EcsB  28.33 
 
 
400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000013948  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1442  ABC transporter permease  24.29 
 
 
403 aa  108  1e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000890644  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1371  ABC transporter, permease protein  23.29 
 
 
407 aa  92.8  7e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0426454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0964  ABC transporter EcsB  26.63 
 
 
403 aa  86.3  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4219  ABC transporter, permease protein EscB  29.84 
 
 
403 aa  79.7  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.0623448 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1923  ABC transporter EcsB  22.62 
 
 
407 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0127322  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1889  ABC transporter EcsB  22.62 
 
 
407 aa  75.9  0.0000000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.133724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1085  ABC transporter, permease protein EscB  31.85 
 
 
403 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1463  ABC transporter EcsB  31.01 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1214  ABC transporter, permease protein EscB  31.85 
 
 
403 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0816  ABC transporter EcsB  29.82 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494679  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0969  ABC transporter, permease  31.21 
 
 
403 aa  74.7  0.000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0959  ABC transporter, permease  31.85 
 
 
403 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1049  ABC transporter permease  31.85 
 
 
403 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1126  ABC transporter, permease protein EscB  31.85 
 
 
403 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1153  ABC transporter, permease protein EscB  31.85 
 
 
403 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0980  ABC transporter permease EscB  31.85 
 
 
403 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1273  ABC transporter permease  27.27 
 
 
352 aa  73.6  0.000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.957115  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0646  ABC transporter EcsB  27.87 
 
 
404 aa  70.9  0.00000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4437  putative permease  21.65 
 
 
399 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0761847 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0900  putative permease  22.22 
 
 
399 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.864791  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0754  ABC transporter EcsB  25.57 
 
 
399 aa  65.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1028  putative permease  26.28 
 
 
399 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0936  permease, putative  26.28 
 
 
399 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0804  permease  22.91 
 
 
399 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0753  hypothetical protein  22.91 
 
 
399 aa  64.7  0.000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0844  permease  22.91 
 
 
399 aa  65.1  0.000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0682  ABC transporter EcsB  26.7 
 
 
404 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0940  putative permease  22.6 
 
 
399 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000325724 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0748  hypothetical protein  21.95 
 
 
399 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1226  ABC transporter permease  32 
 
 
428 aa  59.7  0.00000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>