31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_1273 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_1273  ABC transporter permease  100 
 
 
352 aa  697    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.957115  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2277  ABC transporter permease  27.8 
 
 
339 aa  100  3e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0374  ABC transporter, permease protein  26.35 
 
 
344 aa  81.6  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1261  ABC transporter EcsB  24.37 
 
 
400 aa  73.9  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000013948  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1571  ABC transporter permease  23.15 
 
 
345 aa  68.9  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1442  ABC transporter permease  24.32 
 
 
403 aa  68.2  0.0000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000890644  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0804  permease  19.95 
 
 
399 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0844  permease  19.95 
 
 
399 aa  67  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0940  putative permease  19.69 
 
 
399 aa  65.1  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000325724 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0753  hypothetical protein  19.69 
 
 
399 aa  64.7  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0748  hypothetical protein  19.69 
 
 
399 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0646  ABC transporter EcsB  19.76 
 
 
404 aa  62.4  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4437  putative permease  19.17 
 
 
399 aa  57.8  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0761847 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0936  permease, putative  19.95 
 
 
399 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0900  putative permease  18.65 
 
 
399 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.864791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1028  putative permease  19.95 
 
 
399 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0754  ABC transporter EcsB  18.39 
 
 
399 aa  56.2  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1049  ABC transporter permease  21.52 
 
 
403 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0980  ABC transporter permease EscB  21.52 
 
 
403 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1214  ABC transporter, permease protein EscB  22.05 
 
 
403 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1085  ABC transporter, permease protein EscB  24.44 
 
 
403 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1153  ABC transporter, permease protein EscB  24.44 
 
 
403 aa  53.9  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1126  ABC transporter, permease protein EscB  24.31 
 
 
403 aa  53.5  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0959  ABC transporter, permease  23.46 
 
 
403 aa  53.1  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0969  ABC transporter, permease  22.31 
 
 
403 aa  52.8  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4219  ABC transporter, permease protein EscB  21 
 
 
403 aa  52  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.0623448 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1371  ABC transporter, permease protein  23.14 
 
 
407 aa  52  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0426454  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0682  ABC transporter EcsB  18.13 
 
 
404 aa  51.2  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0964  ABC transporter EcsB  23.08 
 
 
403 aa  51.2  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1226  ABC transporter permease  31.87 
 
 
428 aa  48.1  0.0002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0816  ABC transporter EcsB  22.93 
 
 
403 aa  44.3  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494679  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>