34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2277 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_2277  ABC transporter permease  100 
 
 		 339 aa  662    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0374  ABC transporter, permease protein  40.58 
 
 		 344 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1571  ABC transporter permease  37.3 
 
 		 345 aa  178  1e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1261  ABC transporter EcsB  27.46 
 
 		 400 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000013948  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1371  ABC transporter, permease protein  26.39 
 
 		 407 aa  111  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0426454  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1442  ABC transporter permease  24.22 
 
 		 403 aa  105  8e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000890644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1463  ABC transporter EcsB  26.58 
 
 		 404 aa  98.2  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0964  ABC transporter EcsB  26.1 
 
 		 403 aa  90.5  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1153  ABC transporter, permease protein EscB  32.76 
 
 		 403 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1889  ABC transporter EcsB  23.33 
 
 		 407 aa  86.3  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.133724  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1923  ABC transporter EcsB  23.33 
 
 		 407 aa  86.3  7e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0127322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1049  ABC transporter permease  32.76 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1126  ABC transporter, permease protein EscB  32.76 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0980  ABC transporter permease EscB  32.76 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4219  ABC transporter, permease protein EscB  33.33 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.0623448 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1085  ABC transporter, permease protein EscB  32.76 
 
 		 403 aa  85.5  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1214  ABC transporter, permease protein EscB  32.18 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0959  ABC transporter, permease  32.18 
 
 		 403 aa  83.6  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0646  ABC transporter EcsB  32.09 
 
 		 404 aa  83.6  0.000000000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1273  ABC transporter permease  27.51 
 
 		 352 aa  82  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.957115  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0969  ABC transporter, permease  32.18 
 
 		 403 aa  82  0.00000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0816  ABC transporter EcsB  40.14 
 
 		 403 aa  80.5  0.00000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0844  permease  25.31 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0804  permease  25.31 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0936  permease, putative  25.31 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0940  putative permease  25.31 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000325724 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0900  putative permease  25.29 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.864791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1028  putative permease  25.31 
 
 		 399 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0753  hypothetical protein  25.31 
 
 		 399 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0748  hypothetical protein  24.69 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4437  putative permease  24.69 
 
 		 399 aa  72.8  0.000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0761847 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0754  ABC transporter EcsB  24.54 
 
 		 399 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0682  ABC transporter EcsB  30.88 
 
 		 404 aa  67  0.0000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1226  ABC transporter permease  28.12 
 
 		 428 aa  56.6  0.0000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>