34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LGAS_1442 on replicon NC_008530
Organism: Lactobacillus gasseri ATCC 33323



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008530  LGAS_1442  ABC transporter permease  100 
 
 		 403 aa  812    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000890644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1261  ABC transporter EcsB  27.92 
 
 		 400 aa  137  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.0000000013948  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2277  ABC transporter permease  24.22 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0374  ABC transporter, permease protein  23.76 
 
 		 344 aa  102  1e-20  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0646  ABC transporter EcsB  24.36 
 
 		 404 aa  87.8  3e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1226  ABC transporter permease  25.06 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1463  ABC transporter EcsB  22.67 
 
 		 404 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0964  ABC transporter EcsB  24.7 
 
 		 403 aa  78.6  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1153  ABC transporter, permease protein EscB  23.97 
 
 		 403 aa  76.3  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1085  ABC transporter, permease protein EscB  24.19 
 
 		 403 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1214  ABC transporter, permease protein EscB  23.49 
 
 		 403 aa  72  0.00000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1049  ABC transporter permease  23.56 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0980  ABC transporter permease EscB  23.56 
 
 		 403 aa  71.2  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1126  ABC transporter, permease protein EscB  23.56 
 
 		 403 aa  70.9  0.00000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4219  ABC transporter, permease protein EscB  22.82 
 
 		 403 aa  70.5  0.00000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.125953  normal  0.0623448 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0959  ABC transporter, permease  24.04 
 
 		 403 aa  69.7  0.00000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1923  ABC transporter EcsB  22.27 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0127322  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1889  ABC transporter EcsB  22.27 
 
 		 407 aa  68.9  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.133724  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0969  ABC transporter, permease  24.34 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4437  putative permease  22.94 
 
 		 399 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.192988  normal  0.0761847 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0816  ABC transporter EcsB  23.97 
 
 		 403 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494679  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0844  permease  22.94 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0748  hypothetical protein  22.94 
 
 		 399 aa  62.8  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0940  putative permease  22.08 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000325724 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0753  hypothetical protein  22.08 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0804  permease  22.94 
 
 		 399 aa  62.4  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1571  ABC transporter permease  22.77 
 
 		 345 aa  62  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0682  ABC transporter EcsB  23.14 
 
 		 404 aa  61.6  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0900  putative permease  22.44 
 
 		 399 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.864791  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1028  putative permease  22.44 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0936  permease, putative  22.44 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1371  ABC transporter, permease protein  22.83 
 
 		 407 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0426454  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0754  ABC transporter EcsB  23.17 
 
 		 399 aa  56.6  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1273  ABC transporter permease  24.74 
 
 		 352 aa  55.5  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.957115  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>