95 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3054 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3054  4'-phosphopantetheinyl transferase  100 
 
 
200 aa  390  1e-108  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00748025 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0685  4'-phosphopantetheinyl transferase  48.89 
 
 
231 aa  123  2e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.273941  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1716  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.55 
 
 
243 aa  62  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2098  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.17 
 
 
226 aa  56.2  0.0000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.148258  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0737  phosphopantethiene-protein transferase  29.17 
 
 
209 aa  55.8  0.0000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00789622  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2191  4'-phosphopantetheinyl transferase  38.89 
 
 
251 aa  55.5  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.230449  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0849  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.86 
 
 
236 aa  54.7  0.0000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2583  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.07 
 
 
270 aa  54.7  0.0000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3838  4'-phosphopantetheinyl transferase  40.66 
 
 
226 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0099  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.88 
 
 
248 aa  54.3  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0084  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.25 
 
 
195 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1096  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.71 
 
 
251 aa  53.1  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4684  phosphopantethiene-protein transferase  24.52 
 
 
245 aa  52.8  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.552337  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4810  4'-phosphopantetheinyl transferase  33.12 
 
 
237 aa  52.4  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.45977  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0848  hypothetical protein  28.57 
 
 
245 aa  52.4  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2597  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.38 
 
 
237 aa  52.4  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0823  hypothetical protein  27.63 
 
 
245 aa  52.4  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4807  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.19 
 
 
244 aa  52  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.041874  hitchhiker  0.000293252 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3191  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.9 
 
 
238 aa  51.6  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1875  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.64 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.319598  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2722  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.02 
 
 
266 aa  51.2  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.692762  normal  0.269633 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0314  phosphopantetheinyl transferase  27.34 
 
 
243 aa  51.2  0.00001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000771754  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2006  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.01 
 
 
234 aa  50.4  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1522  4'-phosphopantetheinyltransferase family protein  33.55 
 
 
269 aa  50.4  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0110417  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4815  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  34.59 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3957  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  34.59 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0644  4'-phosphopantetheinyl transferase  30.66 
 
 
235 aa  49.7  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0672756  normal  0.714945 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3759  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  34.59 
 
 
195 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0240  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.59 
 
 
195 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03277  hypothetical protein  34.59 
 
 
195 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3847  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  34.59 
 
 
189 aa  49.3  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3674  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  34.59 
 
 
195 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03324  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  34.59 
 
 
195 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4073  o252  35.14 
 
 
251 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.818043  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2174  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.51 
 
 
251 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.550265  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5903  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.51 
 
 
251 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.182715  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4237  hypothetical protein  35.14 
 
 
251 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.049978  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4180  hypothetical protein  35.14 
 
 
251 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4058  o252  35.14 
 
 
251 aa  48.9  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.145849  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1056  phosphopantetheinyl transferase-like protein  29.66 
 
 
251 aa  48.9  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.176797  normal  0.0459855 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0241  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  33.83 
 
 
195 aa  48.1  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5616  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.73 
 
 
198 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4130  hypothetical protein  33.78 
 
 
251 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.169963  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0026  4'-phosphopantetheinyl transferase, CesP  27.34 
 
 
251 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3806  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.78 
 
 
233 aa  47.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.153231 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0085  4'-phosphopantetheinyl transferase  27.82 
 
 
241 aa  47  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2494  Beta-ketoacyl synthase  32.05 
 
 
1453 aa  46.6  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.96342  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5484  4'-phosphopantetheinyl transferase  35.71 
 
 
251 aa  47  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.235077  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17312  predicted protein  35.58 
 
 
217 aa  46.2  0.0003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0056832  normal  0.0249037 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1085  phosphopantetheinyl transferase-like protein  27.61 
 
 
235 aa  46.6  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0059  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.62 
 
 
314 aa  46.2  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0159865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0531  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.41 
 
 
267 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.351031 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2464  4'-phosphopantetheinyl transferase family protein  20.18 
 
 
208 aa  45.4  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0671  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.21 
 
 
235 aa  45.4  0.0005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3955  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  32.09 
 
 
192 aa  45.1  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.786973  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4079  hypothetical protein  32.43 
 
 
249 aa  45.1  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.995337 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5143  hypothetical protein  32.43 
 
 
249 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.156645 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2032  4'-phosphopantetheinyl transferase  23.98 
 
 
211 aa  45.1  0.0007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00275592 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03596  predicted phosphopantetheinyl transferase  32.43 
 
 
253 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2213  4'-phosphopantetheinyl transferase  34.45 
 
 
251 aa  45.1  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4210  hypothetical protein  32.43 
 
 
249 aa  45.1  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4282  hypothetical protein  32.43 
 
 
249 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4221  hypothetical protein  32.43 
 
 
249 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3926  hypothetical protein  32.43 
 
 
249 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1805  HetI protein-like  35.43 
 
 
259 aa  45.1  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.165373 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4255  conserved hypothetical protein  32.43 
 
 
249 aa  45.1  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3186  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.52 
 
 
253 aa  44.7  0.0009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.23954  n/a   
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9644  Phosphopantetheinyl transferase  31.97 
 
 
185 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.411221  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0547  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.5 
 
 
243 aa  44.3  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.105743  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2444  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.03 
 
 
257 aa  44.3  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.125975  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0929  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.47 
 
 
294 aa  44.3  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.13872 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1833  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.26 
 
 
280 aa  43.1  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2120  4'-phosphopantetheinyl transferase  32.64 
 
 
228 aa  43.5  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3852  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  31.34 
 
 
192 aa  43.1  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3895  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  31.34 
 
 
192 aa  43.5  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1604  phosphopantetheinyl transferase-like  24.05 
 
 
247 aa  42.7  0.003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3785  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  29.85 
 
 
192 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3775  holo-(acyl carrier protein) synthase 2  31.34 
 
 
192 aa  43.1  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.595249  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2822  4'-phosphopantetheinyl transferase  36.84 
 
 
251 aa  42.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0154  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.47 
 
 
223 aa  42.7  0.004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.749377  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1676  4-phosphopantetheinyl transferase family protein  29.84 
 
 
265 aa  42.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.347455  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2086  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.66 
 
 
210 aa  42.4  0.005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.684942  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1491  4'-phosphopantetheinyl transferase  28.23 
 
 
238 aa  42.4  0.005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.000000379321  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3106  4-phosphopantetheinyl transferase  26 
 
 
282 aa  42  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.699639  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6934  4'-phosphopantetheinyl transferase, putative  34.48 
 
 
253 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5205  4'-phosphopantetheinyl transferase  26.63 
 
 
239 aa  42  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2916  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.88 
 
 
241 aa  42  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1005  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.18 
 
 
236 aa  42  0.006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1143  hypothetical protein  26.89 
 
 
206 aa  42  0.006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2984  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.84 
 
 
282 aa  41.6  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0867151  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5313  4'-phosphopantetheinyl transferase  24.81 
 
 
243 aa  41.6  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1788  4'-phosphopantetheinyl transferase  29.77 
 
 
360 aa  41.2  0.009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4145  hypothetical protein  29.73 
 
 
248 aa  41.6  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0477  4'-phosphopantetheinyl transferase  25.16 
 
 
238 aa  41.2  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3968  4'-phosphopantetheinyl transferase  31.82 
 
 
199 aa  41.2  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>